More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1141 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1141  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
347 aa  711    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.261059  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  57.06 
 
 
347 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  57.23 
 
 
347 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  57.06 
 
 
347 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3616  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  56.94 
 
 
347 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3519  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  56.94 
 
 
347 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02017  galactitol-1-phosphate dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  53.78 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1567  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.78 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0173762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  53.78 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0973  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  53.78 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.465963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2227  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  53.78 
 
 
346 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01983  hypothetical protein  53.78 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2379  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  53.78 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1147  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  53.78 
 
 
346 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3070  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  53.78 
 
 
346 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862081  hitchhiker  0.00000818535 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3384  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.84 
 
 
345 aa  315  7e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000451542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1007  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.08 
 
 
348 aa  249  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.706693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14560  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.21 
 
 
352 aa  229  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0972559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.48 
 
 
351 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  36.92 
 
 
347 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.58 
 
 
356 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
347 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
347 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 
369 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.237052  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4595  hypothetical protein  32.38 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1805  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657982  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.09 
 
 
347 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4593  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.19 
 
 
346 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.675343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.04 
 
 
344 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  34.83 
 
 
347 aa  156  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
347 aa  155  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  33.88 
 
 
347 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  31.38 
 
 
359 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  34.83 
 
 
347 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.83 
 
 
347 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  34.83 
 
 
347 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  36.96 
 
 
347 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  35.53 
 
 
347 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.86 
 
 
343 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
354 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.86 
 
 
343 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
354 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.49 
 
 
350 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.18 
 
 
354 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.54 
 
 
352 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
364 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.78 
 
 
350 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.88 
 
 
354 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.78 
 
 
350 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
354 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.9 
 
 
350 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
350 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.9 
 
 
350 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
365 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
350 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  31.49 
 
 
350 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  31.49 
 
 
350 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.49 
 
 
350 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 
340 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  29.53 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.31 
 
 
349 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  31.27 
 
 
348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  29.24 
 
 
363 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  32.65 
 
 
363 aa  145  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  30.29 
 
 
355 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.22 
 
 
346 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.27 
 
 
342 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
345 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.85 
 
 
329 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  28.86 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.45 
 
 
373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  33.45 
 
 
373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  33.45 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
337 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
342 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  32.62 
 
 
336 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.03 
 
 
341 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.22 
 
 
341 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
362 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  33.1 
 
 
373 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
347 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.06 
 
 
336 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  28.74 
 
 
362 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.15 
 
 
350 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.79 
 
 
343 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
362 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  29.62 
 
 
360 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  31.94 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  29.34 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.2 
 
 
343 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.58 
 
 
323 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.4 
 
 
356 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.74 
 
 
373 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.57 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0233  L-threonine 3-dehydrogenase  32.62 
 
 
345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.43371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
341 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.82 
 
 
340 aa  135  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>