More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0767 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0767  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
312 aa  619  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000173406  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2807  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
326 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4334  Monosaccharide-transporting ATPase  39.93 
 
 
327 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.731249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4597  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.87 
 
 
328 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0491755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3087  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.5 
 
 
343 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154884  normal  0.401469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2367  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  37.41 
 
 
319 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4157  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.26 
 
 
321 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.645067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0573  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  37.76 
 
 
321 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1110  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  39.68 
 
 
334 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.963711  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2151  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.78 
 
 
319 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144836  normal  0.707296 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2019  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  39.41 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1853  putative ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  39.41 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1866  putative ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  39.41 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1017  sugar-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  36.03 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.353153  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2475  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  39.03 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.77 
 
 
318 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186495  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0882  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.32 
 
 
319 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577745  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2204  monosaccharide-transporting ATPase  36.14 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00482964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0947  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.6 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103002  normal  0.0230828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2263  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.95 
 
 
320 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1997  ABC ribose transporter, periplasmic ligand binding protein  37.92 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1126  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.26 
 
 
316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1237  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.95 
 
 
318 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0190495  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1606  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.26 
 
 
316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.099451  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1583  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.26 
 
 
316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0401008  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4745  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  39.26 
 
 
316 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193376  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1503  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.33 
 
 
316 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4554  D-allose transporter subunit  37.1 
 
 
313 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.33 
 
 
316 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39428  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03960  D-allose transporter subunit  37.1 
 
 
311 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3903  Monosaccharide-transporting ATPase  37.1 
 
 
311 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3938  D-allose transporter subunit  37.1 
 
 
311 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03920  hypothetical protein  37.1 
 
 
311 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1631  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.95 
 
 
316 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.817449  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39350  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  38.15 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  34.03 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3346  ribose ABC transporter periplasmic binding protein  37.18 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  35.23 
 
 
307 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.58 
 
 
311 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1956  monosaccharide-transporting ATPase  36.76 
 
 
318 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0141518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3492  monosaccharide-transporting ATPase  36.1 
 
 
319 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.324039 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3044  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.01 
 
 
330 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3236  monosaccharide-transporting ATPase  35.87 
 
 
319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.271334  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2133  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.71 
 
 
320 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0343  D-ribose transporter subunit RbsB  34.04 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  35.88 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2454  monosaccharide-transporting ATPase  35.02 
 
 
319 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1401  ribose ABC transporter, substrate binding protein  35.14 
 
 
315 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  33.21 
 
 
289 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4136  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.98 
 
 
322 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.05 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2685  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
306 aa  155  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.450778  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4636  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.01 
 
 
318 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1985  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
306 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1336  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  35.89 
 
 
312 aa  152  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.454554 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1272  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.37 
 
 
330 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.269718  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06143  D-ribose transporter subunit RbsB  33.33 
 
 
292 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0344  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.8 
 
 
306 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000339  ribose ABC transport system ribose-binding protein RbsB  32.78 
 
 
292 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1618  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 
316 aa  149  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.34 
 
 
315 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0039  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.67 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.11 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0558  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  32.21 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0008  D-ribose transporter subunit RbsB  31.08 
 
 
294 aa  146  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1369  D-ribose transporter subunit RbsB  33.71 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0517  D-ribose transporter subunit RbsB  32.18 
 
 
299 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4196  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.87 
 
 
318 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4132  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.46 
 
 
329 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4898  D-ribose transporter subunit RbsB  31.54 
 
 
296 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00612951  hitchhiker  0.000000869292 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5319  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.05 
 
 
315 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0693893  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4525  D-ribose transporter subunit RbsB  30.43 
 
 
295 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00203677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4167  D-ribose transporter subunit RbsB  31.44 
 
 
296 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4111  D-ribose transporter subunit RbsB  31.44 
 
 
296 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.817672  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4096  D-ribose transporter subunit RbsB  31.44 
 
 
296 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2435  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  32.75 
 
 
316 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.919395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4217  D-ribose transporter subunit RbsB  31.44 
 
 
296 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  normal  0.765182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4235  D-ribose transporter subunit RbsB  30.43 
 
 
295 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000930744  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7364  ABC transporter substrate binding protein  34.98 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4276  D-ribose transporter subunit RbsB  31.44 
 
 
296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26220  Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator protein  32.99 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0114  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  34.16 
 
 
322 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.686148  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03637  D-ribose transporter subunit  30.77 
 
 
296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00458293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5187  D-ribose transporter subunit RbsB  30.77 
 
 
296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0574953  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4119  D-ribose transporter subunit RbsB  30.77 
 
 
296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4243  D-ribose transporter subunit RbsB  30.77 
 
 
296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03582  hypothetical protein  30.77 
 
 
296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00518541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1642  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.69 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000807495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3967  D-ribose transporter subunit RbsB  31.4 
 
 
294 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.56483  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4267  D-ribose transporter subunit RbsB  31.4 
 
 
294 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00505283  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4216  Monosaccharide-transporting ATPase  30.77 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4113  D-ribose transporter subunit RbsB  31.06 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114782  normal  0.0406773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0500  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.04 
 
 
321 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3975  D-ribose transporter subunit RbsB  31.23 
 
 
296 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0740173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3164  Monosaccharide-transporting ATPase  34.05 
 
 
310 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3783  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.8 
 
 
313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608988 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4724  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.75 
 
 
321 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847627  normal  0.102822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0363  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.53 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879984  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4201  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.75 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525633  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4172  D-ribose transporter subunit RbsB  30.38 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000287299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>