261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0739 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  53.1 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  51.28 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0307  hypothetical protein  53.98 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.432671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0313  hypothetical protein  52.21 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  54.63 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  47.01 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  46.15 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  47.01 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  47.01 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  47.01 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  47.01 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  47.01 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  46.9 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  50.44 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  50.44 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  50.44 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  45.3 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  46.15 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  41.23 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  43.59 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  40.17 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  48.98 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0202  hypothetical protein  44.25 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  43.59 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  44.14 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  42.24 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  44.14 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  42.24 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  47 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  42.24 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0216  hypothetical protein  42.48 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0192793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3391  hypothetical protein  43.93 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3148  hypothetical protein  45.1 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0290  hypothetical protein  46.39 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3340  hypothetical protein  46.43 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0271  hypothetical protein  43.93 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0679864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  41.38 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2816  hypothetical protein  43.93 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2801  hypothetical protein  45.1 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  45.36 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0041  hypothetical protein  45.1 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3900  hypothetical protein  45.1 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0024  hypothetical protein  45.1 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1742  hypothetical protein  45.1 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3176  hypothetical protein  45.1 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  43.9 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3819  hypothetical protein  45.1 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  38.6 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  44.63 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  40.52 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  41.46 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  45 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  38.84 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  42.11 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  38.79 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  38.02 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  37.72 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  44.33 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  40.87 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  40.54 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  36.28 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  40.91 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  33.04 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  42.72 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  35.29 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  35.09 
 
 		 117 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  35.34 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3053  protein of unknown function UPF0102  34.78 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  38.18 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  37.84 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  37.84 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  37.39 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  46.36 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  42.11 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  35.45 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  36.84 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  36.45 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  34.65 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  38.32 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  37.74 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  35.83 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  37.61 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  36.79 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  36.79 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  36.79 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  36.79 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  34.69 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  42 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  34.95 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  38.68 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  36.61 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>