More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1055 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1055  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 		 560 aa  1141    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.573369 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  33.92 
 
 		 542 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  35.71 
 
 		 532 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.15 
 
 		 566 aa  325  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  36.43 
 
 		 518 aa  323  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 563 aa  319  7e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  33.57 
 
 		 540 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  34.24 
 
 		 544 aa  317  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  33.16 
 
 		 562 aa  316  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  34.43 
 
 		 553 aa  316  8e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  33.57 
 
 		 541 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  33.39 
 
 		 588 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.68 
 
 		 597 aa  313  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  33.1 
 
 		 542 aa  313  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  33.52 
 
 		 541 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.59 
 
 		 575 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  34.88 
 
 		 576 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  36.95 
 
 		 566 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 587 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.11 
 
 		 616 aa  310  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  34.16 
 
 		 545 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  33.75 
 
 		 547 aa  310  5e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  33.81 
 
 		 527 aa  310  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 550 aa  310  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  32.56 
 
 		 588 aa  309  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5948  ABC transporter related  34.22 
 
 		 563 aa  309  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.934886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  33.8 
 
 		 575 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  34.43 
 
 		 533 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  35.23 
 
 		 586 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.92 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  34.38 
 
 		 539 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  35.04 
 
 		 571 aa  307  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  33.57 
 
 		 530 aa  306  6e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  34.04 
 
 		 541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  33.33 
 
 		 548 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  33.98 
 
 		 535 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  33.75 
 
 		 545 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  33.57 
 
 		 559 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  34.8 
 
 		 565 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  33.33 
 
 		 548 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  34.01 
 
 		 539 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  33.03 
 
 		 566 aa  302  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  33.21 
 
 		 568 aa  302  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  35.47 
 
 		 564 aa  302  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 573 aa  302  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  33.04 
 
 		 555 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.45 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  33.15 
 
 		 593 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  34.06 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  33.45 
 
 		 522 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  34.45 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0598  ABC transporter related  34.65 
 
 		 588 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  33.27 
 
 		 536 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  34.24 
 
 		 557 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  34.28 
 
 		 554 aa  300  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  33.76 
 
 		 603 aa  301  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  34.39 
 
 		 530 aa  300  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  32.57 
 
 		 611 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  32.86 
 
 		 531 aa  300  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  33.21 
 
 		 555 aa  300  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  35.21 
 
 		 606 aa  300  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  32.68 
 
 		 629 aa  300  5e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0842  ABC transporter related  34.19 
 
 		 593 aa  300  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0423448 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  33.75 
 
 		 542 aa  300  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  33.39 
 
 		 539 aa  299  7e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2236  ATPase  33.22 
 
 		 554 aa  300  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.274783 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  34.85 
 
 		 542 aa  299  9e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.58 
 
 		 564 aa  299  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  31.21 
 
 		 686 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  33.76 
 
 		 593 aa  299  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  33.21 
 
 		 534 aa  299  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  34.22 
 
 		 547 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1949  ABC transporter related  34.59 
 
 		 531 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.267995  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  33.64 
 
 		 552 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  33.21 
 
 		 569 aa  298  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  32.72 
 
 		 534 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  33.87 
 
 		 544 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  36.43 
 
 		 532 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  33.87 
 
 		 544 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  32.74 
 
 		 602 aa  297  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  32.18 
 
 		 549 aa  297  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 867 aa  297  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.18 
 
 		 599 aa  297  4e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  34.59 
 
 		 565 aa  297  4e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  32.97 
 
 		 567 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.93 
 
 		 623 aa  296  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  33.39 
 
 		 547 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  32.97 
 
 		 543 aa  296  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  33.39 
 
 		 539 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.27 
 
 		 590 aa  296  8e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  33.68 
 
 		 531 aa  296  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.99 
 
 		 620 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  34.16 
 
 		 573 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  32.5 
 
 		 569 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  31.97 
 
 		 619 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.5 
 
 		 619 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.63 
 
 		 596 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  33.21 
 
 		 545 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  34.76 
 
 		 536 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>