More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0598 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0598  ABC transporter related  100 
 
 
588 aa  1162    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  52.71 
 
 
573 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  52.74 
 
 
583 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  51.75 
 
 
575 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  52.89 
 
 
577 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  51.31 
 
 
624 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  50.17 
 
 
568 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.17 
 
 
626 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  49.39 
 
 
570 aa  510  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  51.25 
 
 
613 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  50.09 
 
 
612 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  50.09 
 
 
624 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  47.84 
 
 
623 aa  497  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  49.57 
 
 
568 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  49.13 
 
 
623 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  49.13 
 
 
623 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  48.95 
 
 
623 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  49.13 
 
 
623 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  47.48 
 
 
623 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 
629 aa  491  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.02 
 
 
629 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.77 
 
 
611 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.06 
 
 
625 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  48.46 
 
 
609 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  47.65 
 
 
623 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  48.95 
 
 
623 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.39 
 
 
612 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  49.4 
 
 
611 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  49.4 
 
 
633 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 
623 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  51.45 
 
 
619 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  48.81 
 
 
615 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 
623 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.55 
 
 
625 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 
623 aa  488  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3157  ABC transporter for oligopeptide ATP-binding protein  46.99 
 
 
587 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  49.58 
 
 
640 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  47.39 
 
 
612 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 
623 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  48.16 
 
 
625 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  43.43 
 
 
627 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.61 
 
 
633 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  46.83 
 
 
611 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 
629 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.09 
 
 
633 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.39 
 
 
640 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  45.83 
 
 
606 aa  484  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  43.77 
 
 
609 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.74 
 
 
632 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  46.5 
 
 
629 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.29 
 
 
637 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  46.86 
 
 
601 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  48.43 
 
 
611 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  47.47 
 
 
629 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  46.84 
 
 
630 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  45.03 
 
 
617 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.3 
 
 
633 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  45.88 
 
 
631 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  47.57 
 
 
627 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  48.13 
 
 
562 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.08 
 
 
632 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.72 
 
 
634 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.49 
 
 
634 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.53 
 
 
623 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.83 
 
 
617 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.49 
 
 
634 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.92 
 
 
629 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 
631 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  49.13 
 
 
613 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  44.5 
 
 
578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  47.56 
 
 
593 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.81 
 
 
633 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.38 
 
 
643 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  42.7 
 
 
617 aa  469  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  46.27 
 
 
593 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  47.15 
 
 
609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 
649 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  51.16 
 
 
545 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.63 
 
 
623 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  45.49 
 
 
619 aa  465  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
623 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  50.36 
 
 
542 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  47.06 
 
 
537 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
550 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.19 
 
 
619 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.81 
 
 
571 aa  465  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  45.79 
 
 
588 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  50.54 
 
 
542 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  45.18 
 
 
583 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  49.91 
 
 
550 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  46.46 
 
 
597 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  50.36 
 
 
542 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
541 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  47.89 
 
 
545 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  49.91 
 
 
543 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  47.37 
 
 
553 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  46.4 
 
 
611 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  49.91 
 
 
543 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  45.22 
 
 
640 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.52 
 
 
534 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>