More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0130 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
355 aa  727    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  64.27 
 
 
351 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.51 
 
 
351 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.64 
 
 
349 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.7 
 
 
349 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.94 
 
 
356 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
355 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.82 
 
 
366 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.26 
 
 
353 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.35 
 
 
344 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.35 
 
 
344 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.35 
 
 
344 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.35 
 
 
344 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.47 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.24 
 
 
345 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
341 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.71 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.18 
 
 
341 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.53 
 
 
342 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.73 
 
 
341 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0695  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.82 
 
 
353 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  56.4 
 
 
365 aa  378  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  55.08 
 
 
365 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
349 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.15 
 
 
341 aa  315  5e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.58 
 
 
347 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.3 
 
 
335 aa  294  2e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.13 
 
 
341 aa  282  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.56 
 
 
337 aa  282  7.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.63 
 
 
342 aa  282  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.22 
 
 
333 aa  278  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
325 aa  278  9e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.94 
 
 
339 aa  278  9e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.14 
 
 
336 aa  278  9e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
348 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.53 
 
 
328 aa  277  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
349 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
349 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
349 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
348 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.7 
 
 
339 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
348 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
348 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
344 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
344 aa  277  3e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.05 
 
 
353 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.14 
 
 
325 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
348 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
348 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
340 aa  273  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.25 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.64 
 
 
348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.05 
 
 
332 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
341 aa  272  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.63 
 
 
348 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
332 aa  272  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.31 
 
 
339 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.53 
 
 
342 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
344 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.61 
 
 
340 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.48 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.96 
 
 
341 aa  269  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.98 
 
 
339 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.14 
 
 
344 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.79 
 
 
347 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.14 
 
 
344 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
340 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
340 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4618  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
342 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
339 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
339 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.75 
 
 
349 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
344 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42 
 
 
344 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
352 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.57 
 
 
344 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.57 
 
 
344 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
339 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.76 
 
 
340 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9310  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.46 
 
 
355 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853778  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
348 aa  262  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
348 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.52 
 
 
340 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
339 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.88 
 
 
344 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
344 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.09 
 
 
337 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
336 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.66 
 
 
344 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
344 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
344 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.94 
 
 
344 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
344 aa  259  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.45 
 
 
344 aa  259  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
344 aa  259  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0277  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  43.54 
 
 
340 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.125695 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1448  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.19 
 
 
345 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.6 
 
 
351 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>