More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3116 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3116  transposase  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  63.4 
 
 		 332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.15 
 
 		 369 aa  354  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.15 
 
 		 369 aa  354  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.15 
 
 		 369 aa  354  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.77 
 
 		 369 aa  350  8.999999999999999e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.4 
 
 		 369 aa  348  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.24 
 
 		 373 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  47.49 
 
 		 371 aa  257  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  47.49 
 
 		 403 aa  257  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.24 
 
 		 370 aa  254  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.24 
 
 		 370 aa  254  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.24 
 
 		 370 aa  254  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.73 
 
 		 372 aa  254  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.1 
 
 		 369 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.1 
 
 		 369 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  49.81 
 
 		 384 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  47.15 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.73 
 
 		 366 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.17 
 
 		 376 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  44.4 
 
 		 391 aa  231  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  44.4 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  44.4 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  44.4 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  44.4 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  44.4 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  44.4 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  44.4 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  44.4 
 
 		 391 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  44.02 
 
 		 391 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  44.02 
 
 		 391 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  44.02 
 
 		 391 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.17 
 
 		 359 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.79 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.79 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  52.66 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  47.03 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  50 
 
 		 159 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  41.53 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.53 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  34.22 
 
 		 363 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.22 
 
 		 363 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  32.47 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  32.47 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.48 
 
 		 374 aa  115  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  50 
 
 		 134 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  32.03 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.11 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  47.79 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  29.89 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  27.1 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  27.1 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  27.1 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  27.1 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  27.1 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  27.1 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.77 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  25.09 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  25.09 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  25.09 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  25.09 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.2 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  25.08 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  25.08 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  24.41 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  27.51 
 
 		 412 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.67 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.62 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.48 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.48 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.48 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.48 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.48 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.48 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  23.08 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.62 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.62 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.62 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.62 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.19 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.19 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.93 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  24.54 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.1 
 
 		 499 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 342 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.83 
 
 		 378 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.71 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  25.48 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.02 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2031  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.46 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.76 
 
 		 423 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5208  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.76 
 
 		 423 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0957  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.76 
 
 		 423 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2124  transposase IS116/IS110/IS902  24.34 
 
 		 412 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1319  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.76 
 
 		 423 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622627  normal  0.467675 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4141  putative transposase  42.42 
 
 		 72 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.67819  normal  0.487019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.76 
 
 		 423 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127954  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  26.63 
 
 		 340 aa  52.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>