More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2693 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  100 
 
 		 163 aa  317  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  51.11 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  50.69 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  52.31 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  48.15 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  52.31 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  51.16 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  54.55 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  50.75 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  51.15 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  51.85 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  51.2 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  48.51 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  48.51 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  49.28 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  52.5 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  40 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  41.79 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  39.19 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  45.45 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  45.19 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  39.19 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  43.17 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  38.51 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  41.5 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.51 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  45.19 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  45.19 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  45.93 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  40.71 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  38.67 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  46.15 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  42.76 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.51 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  39.13 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  43.05 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  39.29 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.1 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  39.47 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  41.43 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  41.18 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  39.16 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  45.11 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  40 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  41.38 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  43.61 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  42.04 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  36.62 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  36.42 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  42.96 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  42.96 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  43.45 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  43.45 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  38.41 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  38.41 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.28 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  45.86 
 
 		 518 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  41.48 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  37.24 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  47.86 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.97 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  40.91 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  37.24 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  37.09 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  38.97 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  38.97 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  38.97 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.65 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  43.28 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  36.24 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  41.79 
 
 		 148 aa  111  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.91 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.91 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  41.04 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  40.77 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  37.68 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  41.98 
 
 		 192 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  38.61 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  44.37 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  41.48 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  43.94 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  45.59 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  38.85 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  41.22 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  45.99 
 
 		 533 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  38.35 
 
 		 169 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  39.13 
 
 		 145 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  38.35 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  37.76 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  35.33 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>