221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5076 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 187 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  52.36 
 
 		 193 aa  167  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  51.85 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  46.56 
 
 		 202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  45.99 
 
 		 201 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  45.45 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  45.45 
 
 		 204 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  45.45 
 
 		 204 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  45.45 
 
 		 225 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  45.45 
 
 		 204 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  46.84 
 
 		 193 aa  154  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  45.99 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  47.12 
 
 		 192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  47.12 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  46.03 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  44.44 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  50.27 
 
 		 191 aa  141  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  47.28 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  45.21 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  48.65 
 
 		 184 aa  135  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  45.55 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  41.62 
 
 		 196 aa  130  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  39.67 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  44.21 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  40.22 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  37.5 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  35.05 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  28.87 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  29.95 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  31.41 
 
 		 186 aa  90.9  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  28.87 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  30.98 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  25.76 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  30.43 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  30.85 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  30.81 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  27.27 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  33.54 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  32.73 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  35.44 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  34.16 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  33.54 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  31.01 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  34.16 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  34.16 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  31.69 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  32.92 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  32.92 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  24.47 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  29.45 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  28.65 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  28.65 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  32.26 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  31.01 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  30.57 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  30.38 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  30.57 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  31.21 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  28.65 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  28.65 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  30.57 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  30.57 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  30.57 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  30.57 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  30.57 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  32.26 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  28.12 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  32.67 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  28.65 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  29.49 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  29.03 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  29.03 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  29.03 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  26.67 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  32.21 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  27.16 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  27.42 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  27.13 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  29.55 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  30.38 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  30.38 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  30.38 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  29.69 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  32.94 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  29.56 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  29.75 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  29.75 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  33.95 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  32.74 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  28.89 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  32.03 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  29.56 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  28.88 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  26.18 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  30.67 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  28.48 
 
 		 210 aa  72  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  29.52 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  30.25 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  33.14 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>