85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2519 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2519  protein of unknown function DUF849  100 
 
 		 343 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0339  protein of unknown function DUF849  55.9 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124207  normal  0.72562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1737  hypothetical protein  58.16 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3440  protein of unknown function DUF849  55.65 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3085  hypothetical protein  25.81 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  29.44 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  29.87 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  29.83 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  29.83 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4725  hypothetical protein  25.21 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  29.83 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  29.83 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3440  protein of unknown function DUF849  24.37 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1770  hypothetical protein  29.35 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  28.76 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  29 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  28.09 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  28.09 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  28.09 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  24.78 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  28.09 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  28.39 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  29.63 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  42.86 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  42.86 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  26.52 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  26.52 
 
 		 449 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  27.72 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  28.38 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.72 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  29.63 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.98 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  28.09 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  24.62 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  27.9 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  28.09 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  28.76 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  26.64 
 
 		 298 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  28.76 
 
 		 309 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  25.21 
 
 		 292 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  24.78 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  27.8 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  30.3 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  26.81 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  27.49 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  26.1 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  29.65 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  26.23 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  25.51 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  25.1 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  30.46 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  27.39 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  30.46 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  30.46 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  26.06 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  41.94 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  29.89 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  29.89 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  29.89 
 
 		 309 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  29.89 
 
 		 309 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  24.46 
 
 		 316 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  29.06 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  30.11 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  25.82 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  24.1 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  40.28 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  28.04 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  25.3 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  45.45 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  25.51 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  39.19 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  25.51 
 
 		 280 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  29.55 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.65 
 
 		 271 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  26.32 
 
 		 272 aa  46.2  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  27.71 
 
 		 281 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  26.72 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  28.04 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  25 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  36.21 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.77 
 
 		 294 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  28.49 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  44.68 
 
 		 312 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  40.74 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  24.86 
 
 		 293 aa  42.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>