More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2343 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 		 392 aa  764    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  47.34 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  44.86 
 
 		 408 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  41.98 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  44.25 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  45.52 
 
 		 408 aa  272  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  45.23 
 
 		 423 aa  256  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  40.66 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  40.25 
 
 		 408 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  39.8 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  40.86 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  41.55 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  40.76 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  39.83 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  34.82 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  28.13 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  31.11 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  31.25 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  32.2 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  28.41 
 
 		 397 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4263  monooxygenase FAD-binding  33.89 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000952252  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  28.46 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  29.67 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  28.46 
 
 		 368 aa  107  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  29.51 
 
 		 376 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  29.38 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  29.38 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  31.47 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.65 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  26.16 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.84 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  29.94 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  28.49 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.09 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  30 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  27.04 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.09 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  31.62 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  30.42 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  29.92 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  34.64 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 		 362 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.81 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  25.41 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  34.05 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  35.52 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  32.28 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.49 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  29.64 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  30.59 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  31.92 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  27.93 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  25.52 
 
 		 374 aa  92.8  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  28.99 
 
 		 420 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  28.22 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  29.89 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.92 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  27.22 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  30.81 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  30.97 
 
 		 382 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  25.32 
 
 		 411 aa  90.5  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  32.8 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  27.32 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  30.11 
 
 		 385 aa  89.7  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.66 
 
 		 386 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  29.28 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  29.28 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.77 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  28.34 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  26.32 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  25.93 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  28.36 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.97 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  30.06 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  27.7 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  31.21 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  30.26 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  30.2 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  29.28 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  27.51 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  31.21 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.36 
 
 		 404 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.29 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  29.76 
 
 		 388 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  28.69 
 
 		 382 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  27.19 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  32.03 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  28.88 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  29.09 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  33.8 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  30.16 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.63 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  28.14 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  28.74 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>