36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2155 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  69.57 
 
 		 194 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  41.5 
 
 		 451 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  43.79 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  53.61 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  57.32 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  58.75 
 
 		 389 aa  99.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  54.12 
 
 		 398 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  56.79 
 
 		 391 aa  96.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  55 
 
 		 359 aa  95.9  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  40.13 
 
 		 238 aa  95.5  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  40.43 
 
 		 227 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  54.88 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  40.35 
 
 		 239 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  50 
 
 		 445 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  53.66 
 
 		 209 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  52.44 
 
 		 412 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  57.5 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  36.62 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  43.09 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  45.1 
 
 		 467 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  52.44 
 
 		 145 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  32.74 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  49.38 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  46.99 
 
 		 1995 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  46.34 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  46.99 
 
 		 479 aa  72  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  45.05 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  43.75 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  42.55 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  42.68 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  36.84 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  44.68 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  54.29 
 
 		 871 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>