More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1739 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
242 aa  467  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.92 
 
 
253 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.72 
 
 
254 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
248 aa  99  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0145  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.99 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.24 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  33.8 
 
 
231 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.81 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.95 
 
 
254 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.68 
 
 
257 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 
261 aa  92.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.28 
 
 
256 aa  91.7  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.04 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.58 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.55 
 
 
260 aa  89.4  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
257 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.42 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.99 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.73 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.43 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
259 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 
257 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.94 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  28.23 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  30.66 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  30.66 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.91 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.4 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.27 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 
259 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  33.02 
 
 
261 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.92 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258792  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  33.02 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  35.75 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  33.8 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  30.69 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.95 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.6 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.59 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  30.69 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.83 
 
 
266 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 
303 aa  82  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2484  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.82 
 
 
257 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.585223  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.47 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  32.09 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  24.66 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  27.96 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.2 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  32.09 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  30.23 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  33.17 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  24.2 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  24.63 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  35.75 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  30.89 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.08 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.12 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3640  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
253 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  29.44 
 
 
266 aa  79  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 
265 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
261 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.67 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0212  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.3 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
264 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  25.73 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1416  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.47 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  28.06 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0164  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>