More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0524 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
308 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  59.8 
 
 
307 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  59.4 
 
 
301 aa  349  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  60.6 
 
 
304 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  58.14 
 
 
308 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  58.33 
 
 
349 aa  331  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  56.48 
 
 
307 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  54.64 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  55.78 
 
 
313 aa  318  7e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  53.67 
 
 
299 aa  316  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  58.72 
 
 
494 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  56.15 
 
 
310 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  55.99 
 
 
310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  54.33 
 
 
308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  53.49 
 
 
308 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  51.94 
 
 
305 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  48.37 
 
 
322 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  48.01 
 
 
311 aa  264  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  49.03 
 
 
319 aa  254  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  47.91 
 
 
319 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  47.4 
 
 
317 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  47.4 
 
 
317 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  47.23 
 
 
317 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  46.06 
 
 
327 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  49.01 
 
 
309 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  45.51 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  44.7 
 
 
310 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  43.98 
 
 
270 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  38.31 
 
 
291 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.18 
 
 
308 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  40.41 
 
 
303 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 
310 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
287 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 
284 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 
301 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  35.33 
 
 
297 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 
289 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 
289 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  45.86 
 
 
294 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  45.52 
 
 
307 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  38.64 
 
 
289 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  41.64 
 
 
297 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
288 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  40.42 
 
 
287 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
288 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
290 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 
305 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  45.75 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 
293 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
305 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  35.91 
 
 
317 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.99 
 
 
291 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.99 
 
 
291 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  38.23 
 
 
288 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
287 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  38.3 
 
 
304 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
313 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  37.54 
 
 
288 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 
292 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.04 
 
 
293 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
287 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  39.11 
 
 
283 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  36.81 
 
 
308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 
300 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  58.2 
 
 
350 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  53.28 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  32.2 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 
293 aa  129  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  31.13 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  33.02 
 
 
315 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
291 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
308 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
291 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  48.43 
 
 
324 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 
315 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 
315 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  51.64 
 
 
351 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
315 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 
341 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  30.86 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  39.89 
 
 
324 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  35.21 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  33.22 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 
291 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>