56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0147 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  68.38 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  62.22 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  58.47 
 
 		 147 aa  141  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.56 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  57.63 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  59.26 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  58.33 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.33 
 
 		 294 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  35.64 
 
 		 408 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 138 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  34.18 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  31.31 
 
 		 404 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  31.67 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  36 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  31.63 
 
 		 404 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  29.79 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  31.33 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  32.35 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  39.29 
 
 		 311 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  33.77 
 
 		 332 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 104 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 141 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  28.97 
 
 		 405 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.89 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  27.78 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  28.46 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  30.49 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  31.15 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.84 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  29.85 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  33.33 
 
 		 418 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  33.33 
 
 		 418 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  33.33 
 
 		 418 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  33.33 
 
 		 418 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  33.33 
 
 		 418 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  33.33 
 
 		 418 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 347 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  33.33 
 
 		 418 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  30.77 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1608  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  35.09 
 
 		 469 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.338856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 119 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  33.33 
 
 		 418 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  27.59 
 
 		 159 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>