More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3109 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  92.52 
 
 
441 aa  837    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  81.29 
 
 
434 aa  726    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  79.58 
 
 
432 aa  700    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  81.29 
 
 
434 aa  726    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  100 
 
 
443 aa  894    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  83.75 
 
 
443 aa  756    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  78.59 
 
 
439 aa  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  66.9 
 
 
433 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  58.72 
 
 
437 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  58.35 
 
 
437 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  58.31 
 
 
437 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  59.37 
 
 
435 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  59.29 
 
 
441 aa  495  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  56.85 
 
 
442 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  57.21 
 
 
437 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  58.47 
 
 
436 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  55 
 
 
439 aa  481  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  56.67 
 
 
433 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  56.9 
 
 
454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  54.33 
 
 
438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  54.81 
 
 
427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  56.02 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  54.78 
 
 
431 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  57.69 
 
 
436 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  56.22 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  54.71 
 
 
434 aa  458  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  53.01 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  55.37 
 
 
443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  54.74 
 
 
426 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  58.98 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  59.27 
 
 
440 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  55.37 
 
 
441 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  51.06 
 
 
504 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  53.13 
 
 
434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  55.69 
 
 
422 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  54.99 
 
 
468 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  56.18 
 
 
448 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  53.48 
 
 
442 aa  428  1e-119  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  51.42 
 
 
440 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  56.03 
 
 
489 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  51.53 
 
 
440 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.33 
 
 
474 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  54.01 
 
 
450 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  52.61 
 
 
439 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  51.18 
 
 
440 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  51.46 
 
 
458 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  52.46 
 
 
439 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  52.11 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  49.77 
 
 
487 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  49.55 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  49.4 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  52.88 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  49.78 
 
 
466 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  48.38 
 
 
443 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  50.47 
 
 
438 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 
463 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  51.31 
 
 
438 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  50.59 
 
 
453 aa  408  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  49.53 
 
 
480 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  49.65 
 
 
437 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  50.35 
 
 
434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  48.97 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  49.08 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  49.88 
 
 
442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  48.37 
 
 
445 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  49.77 
 
 
468 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  48.51 
 
 
460 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  49.54 
 
 
452 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  48.13 
 
 
435 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  47.8 
 
 
451 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  48.02 
 
 
451 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  47.58 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0393  flagellum-specific ATP synthase  49.55 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948849  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  47.2 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.74 
 
 
449 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  51.12 
 
 
449 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  54.07 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  46.06 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0553  ATPase FliI/YscN  47.43 
 
 
471 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  50.58 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  47.87 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1640  flagellar protein export ATPase FliI  49.28 
 
 
437 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.117253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  47.43 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1161  flagellar protein export ATPase FliI  48.25 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489016  normal  0.0133257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  47.66 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  52.05 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  47.42 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  44.91 
 
 
448 aa  398  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  50.36 
 
 
439 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.32 
 
 
452 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  48.32 
 
 
452 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4728  flagellar protein export ATPase FliI  48.87 
 
 
479 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696414  normal  0.0278522 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  47.96 
 
 
458 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  49.4 
 
 
458 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3651  ATPase, FliI/YscN family  48.87 
 
 
479 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  49.09 
 
 
451 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  50.47 
 
 
439 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  49.65 
 
 
445 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1116  flagellar protein export ATPase FliI  47.84 
 
 
470 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.12 
 
 
439 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>