38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2613 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  80.75 
 
 		 160 aa  258  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  69.38 
 
 		 159 aa  226  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  42.59 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.51 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  32.71 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.09 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.64 
 
 		 118 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.78 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  41.35 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  37.27 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  35.48 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  34.13 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  34.33 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.45 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.73 
 
 		 117 aa  52.4  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  36 
 
 		 127 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  30.33 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.55 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  30.33 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  31.71 
 
 		 126 aa  47.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  34.45 
 
 		 126 aa  47.4  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  34.02 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  32 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.35 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  35.42 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  32.63 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  33.68 
 
 		 126 aa  44.3  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  35.64 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1257  hypothetical protein  29.17 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.537456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  28.95 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  35.92 
 
 		 126 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  32.99 
 
 		 124 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  26.89 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  35.42 
 
 		 126 aa  41.6  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  30 
 
 		 124 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.53 
 
 		 126 aa  40.8  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>