More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0944 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
284 aa  578  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  81.56 
 
 
284 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  65.37 
 
 
284 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  64.41 
 
 
284 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  62.5 
 
 
280 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  37.79 
 
 
280 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  38.7 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  38.81 
 
 
274 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
279 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  34.93 
 
 
280 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  34.41 
 
 
289 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  33.33 
 
 
287 aa  168  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  34.56 
 
 
455 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 
289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
297 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 
291 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
283 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
300 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 
297 aa  143  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
284 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 
284 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
299 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 
286 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  29.08 
 
 
303 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  28.73 
 
 
298 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
299 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
283 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.28 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 
412 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  30.04 
 
 
353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  34.42 
 
 
352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  34 
 
 
282 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  27.88 
 
 
351 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  31.46 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  32.44 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  36.32 
 
 
302 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 
397 aa  125  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  32.3 
 
 
369 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
408 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  29.93 
 
 
304 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  30.83 
 
 
280 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 
425 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 
397 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.93 
 
 
305 aa  119  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  33.84 
 
 
378 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.76 
 
 
517 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  27.51 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  29.55 
 
 
716 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
285 aa  109  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.2 
 
 
292 aa  109  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  33.17 
 
 
718 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  30 
 
 
287 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  31.43 
 
 
373 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  26.88 
 
 
912 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 
412 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  30.18 
 
 
730 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  28.15 
 
 
505 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 
285 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  31.39 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 
340 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  29.78 
 
 
358 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 
298 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  30 
 
 
724 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  27.01 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  26.64 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  27.67 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  27.24 
 
 
415 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  32 
 
 
509 aa  92.4  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  25.19 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3372  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
295 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.05 
 
 
634 aa  89  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  28.71 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  26.77 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
427 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  29.8 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  25.48 
 
 
279 aa  86.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  25.09 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  27 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  30.24 
 
 
512 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.08 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  27.76 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  31.25 
 
 
480 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  28.72 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  26.9 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  29.33 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.98 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>