135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2017 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  56.68 
 
 
655 aa  752    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  56.68 
 
 
655 aa  753    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  56.68 
 
 
655 aa  752    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  61.15 
 
 
668 aa  780    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  100 
 
 
732 aa  1488    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  56.53 
 
 
655 aa  750    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  44.26 
 
 
900 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  43.85 
 
 
689 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  44.62 
 
 
666 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  43.21 
 
 
756 aa  542  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  44.23 
 
 
638 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  35.39 
 
 
792 aa  339  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  37.01 
 
 
793 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  36.22 
 
 
818 aa  323  6e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  35.65 
 
 
745 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  36.41 
 
 
792 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  35.33 
 
 
815 aa  310  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  36.01 
 
 
816 aa  310  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  34.67 
 
 
663 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  35.33 
 
 
838 aa  306  8.000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  35.86 
 
 
778 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  35.08 
 
 
821 aa  304  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  35.34 
 
 
801 aa  303  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  35.93 
 
 
811 aa  302  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  33.68 
 
 
770 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  35.61 
 
 
775 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  30.98 
 
 
610 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  31.24 
 
 
631 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  29.04 
 
 
623 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  26.53 
 
 
1079 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.08 
 
 
620 aa  197  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.5 
 
 
619 aa  185  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  27.24 
 
 
1026 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  25 
 
 
603 aa  176  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.58 
 
 
640 aa  173  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  29.08 
 
 
526 aa  164  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  24.74 
 
 
628 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.62 
 
 
649 aa  131  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.39 
 
 
480 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.11 
 
 
482 aa  101  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.36 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.31 
 
 
846 aa  74.7  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.47 
 
 
834 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.91 
 
 
504 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.78 
 
 
504 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  19.19 
 
 
489 aa  64.3  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.74 
 
 
673 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.55 
 
 
860 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.56 
 
 
551 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.82 
 
 
822 aa  61.6  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.46 
 
 
835 aa  60.8  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  21.39 
 
 
829 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.77 
 
 
768 aa  60.8  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.73 
 
 
823 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0417  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.7 
 
 
446 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.5 
 
 
687 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.49 
 
 
823 aa  56.6  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.36 
 
 
824 aa  57.4  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.22 
 
 
821 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.11 
 
 
517 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.13 
 
 
573 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  24.55 
 
 
877 aa  53.9  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  24.55 
 
 
877 aa  54.3  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10018  Aminopeptidase N  24.73 
 
 
937 aa  53.9  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  27.78 
 
 
887 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  24.55 
 
 
877 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  25.15 
 
 
877 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  25.15 
 
 
877 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.36 
 
 
518 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  25.15 
 
 
918 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  25.15 
 
 
877 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.83 
 
 
845 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  22.75 
 
 
877 aa  52  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  25.87 
 
 
688 aa  52  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.54 
 
 
822 aa  52  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.79 
 
 
492 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.75 
 
 
538 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  21.72 
 
 
922 aa  50.8  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.76 
 
 
852 aa  50.8  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.07 
 
 
858 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  21.94 
 
 
865 aa  50.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  23.35 
 
 
877 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3582  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.43 
 
 
722 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.564307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.57 
 
 
559 aa  50.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.16 
 
 
878 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.84 
 
 
882 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.48 
 
 
686 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2613  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.85 
 
 
722 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351663  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.85 
 
 
722 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.476849  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0466  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.85 
 
 
722 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.470213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.58 
 
 
866 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  23.5 
 
 
509 aa  48.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  25.63 
 
 
827 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  27.65 
 
 
647 aa  48.1  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  27.65 
 
 
671 aa  47.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1997  M1 family peptidase  26.06 
 
 
628 aa  47.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0324  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.55 
 
 
874 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2267  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.06 
 
 
642 aa  47.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283529  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2589  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.51 
 
 
647 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000915199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2628  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.11 
 
 
647 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000178054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>