74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1209 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1209  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0364  hypothetical protein  35.59 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.947228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  27.53 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  31.41 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  25.57 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  32.31 
 
 		 488 aa  69.7  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  32.31 
 
 		 488 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  27.52 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  32.33 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  27.75 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  28.8 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  28.67 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  24.59 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1113  Tol-Pal system YbgF  27.05 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636864  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  26.34 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  29.01 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  29.07 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  28.77 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  36.36 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  29.78 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1597  hypothetical protein  28.88 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  28.46 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  27.05 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  33 
 
 		 329 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  26.92 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  28.51 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  26.92 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  28.72 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3481  hypothetical protein  40.58 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  23.08 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3336  hypothetical protein  39.13 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  27.37 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  26.82 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  32 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  26.11 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  25.22 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3417  hypothetical protein  39.13 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60033  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  20.48 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  26.88 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  27.88 
 
 		 395 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  25.89 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  23.86 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  26.13 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0006  hypothetical protein  27.78 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000521994  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  24.86 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  22.75 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  29.36 
 
 		 487 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  24.14 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  23.3 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  31.31 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  23.3 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  23.3 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  23.3 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  23.3 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  24.86 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  23.3 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  23.56 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  23.56 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  23.56 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  24.22 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  23.56 
 
 		 249 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>