97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4389 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4389  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  49.25 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.28 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  43.55 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  47.4  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10421  sulfur carrier protein ThiS  48.08 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.3 
 
 		 327 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.76 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.91 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  69.44 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.36 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.36 
 
 		 65 aa  42  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.72 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  36.36 
 
 		 70 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 62 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 75 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  30.3 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  25.76 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.91 
 
 		 331 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.62 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>