More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3738 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  34.43 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  32.71 
 
 		 236 aa  89.4  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  27.07 
 
 		 308 aa  88.6  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.98 
 
 		 580 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21170  glycosyl transferase  30.73 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  45.45 
 
 		 1157 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.79 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00600  glycosyl transferase  32.98 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0724725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 597 aa  75.9  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  35.4 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  37.89 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  35.4 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  35.4 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  35.4 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  35.4 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  35.4 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  41.51 
 
 		 807 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  41.59 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  35.4 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  31.62 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  31.09 
 
 		 292 aa  72  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  33.33 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  21.91 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  39.56 
 
 		 1148 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  37.08 
 
 		 1168 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1777  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0109155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 358 aa  68.9  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  35.11 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  40.66 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  36.64 
 
 		 232 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  39.77 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.48 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  31.87 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 1032 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  31.86 
 
 		 344 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  31.86 
 
 		 344 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  32.74 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.8 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  31.86 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  31.86 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 340 aa  65.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  31.4 
 
 		 479 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  27.48 
 
 		 452 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0098  glycosyltransferase-like protein  28.48 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000850354 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  32.77 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  36.17 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  36.22 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.77 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 1118 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.77 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>