58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3056 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  100 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  62.46 
 
 		 306 aa  349  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  63.53 
 
 		 280 aa  335  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  61.6 
 
 		 270 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  64.15 
 
 		 273 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  64.37 
 
 		 278 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  61.42 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  61.42 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  61.42 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  56.02 
 
 		 275 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  53.69 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  58.77 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  50 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  50.59 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  45.14 
 
 		 263 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  46.22 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  45.3 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  47.47 
 
 		 268 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  50.22 
 
 		 269 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  45.69 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  43.31 
 
 		 259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  43.5 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  44.66 
 
 		 284 aa  210  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  46.03 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  41.91 
 
 		 266 aa  206  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  48.83 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  47.03 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  45.37 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  45.79 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  44.64 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  45.04 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  45.53 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  44.66 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  43.72 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  36.5 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  33.78 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  38.67 
 
 		 152 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  24.51 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.47 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.37 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  26.02 
 
 		 718 aa  45.8  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  27.94 
 
 		 164 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  37.5 
 
 		 747 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.46 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  31.45 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.54 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.54 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  30.16 
 
 		 678 aa  43.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  30.53 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  28.33 
 
 		 212 aa  42.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  28.74 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  32.97 
 
 		 141 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1014  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.63 
 
 		 732 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101534  normal  0.630139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  41.82 
 
 		 720 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0466  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.53 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00151581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>