More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2345 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  100 
 
 
193 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  70.22 
 
 
202 aa  249  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  68.36 
 
 
198 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  67.8 
 
 
198 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  67.8 
 
 
198 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  64.67 
 
 
217 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  61.45 
 
 
196 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  62.23 
 
 
203 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  65.34 
 
 
203 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  57.54 
 
 
195 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  61.24 
 
 
199 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  59.09 
 
 
223 aa  202  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  60.57 
 
 
218 aa  201  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  57.14 
 
 
183 aa  200  9e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  60.57 
 
 
199 aa  200  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  58.76 
 
 
184 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  58.29 
 
 
199 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  58.89 
 
 
180 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  57.14 
 
 
197 aa  197  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  55.38 
 
 
234 aa  197  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  51.03 
 
 
209 aa  194  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  57.71 
 
 
199 aa  194  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  57.87 
 
 
201 aa  193  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  58.86 
 
 
208 aa  191  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  57.71 
 
 
216 aa  188  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  56 
 
 
190 aa  186  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  60.34 
 
 
203 aa  184  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  55.93 
 
 
192 aa  184  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  60 
 
 
188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  59.17 
 
 
173 aa  177  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  55.38 
 
 
194 aa  175  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  54.29 
 
 
208 aa  174  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  50.29 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  47.73 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  52.54 
 
 
204 aa  171  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  47.73 
 
 
188 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  50 
 
 
202 aa  168  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  47.43 
 
 
185 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  49.71 
 
 
191 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  52.05 
 
 
199 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.59 
 
 
200 aa  164  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  43.5 
 
 
198 aa  164  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0915  guanylate kinase  49.72 
 
 
202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  51.4 
 
 
196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  44.07 
 
 
199 aa  158  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  46.07 
 
 
215 aa  158  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  46.59 
 
 
212 aa  157  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  42.29 
 
 
204 aa  157  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  45.71 
 
 
192 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  41.95 
 
 
202 aa  156  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  38.98 
 
 
204 aa  155  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  39.43 
 
 
184 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  38.86 
 
 
184 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  43.89 
 
 
233 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  43.35 
 
 
201 aa  152  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  42.11 
 
 
210 aa  151  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  40.91 
 
 
203 aa  150  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  56.57 
 
 
194 aa  151  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  36.93 
 
 
207 aa  150  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  43.75 
 
 
186 aa  150  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  41.48 
 
 
194 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  41.14 
 
 
185 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  40.57 
 
 
186 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  43.82 
 
 
223 aa  148  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  43.82 
 
 
223 aa  148  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0032  guanylate kinase  44.57 
 
 
205 aa  147  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  42.08 
 
 
207 aa  147  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  37.71 
 
 
184 aa  147  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1870  guanylate kinase  43.55 
 
 
209 aa  147  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.786175  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_33  guanylate kinase  43.43 
 
 
205 aa  147  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  39.43 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  44.63 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  43.17 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  40 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  39.31 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  44.77 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  42.62 
 
 
224 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  41.99 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  42.08 
 
 
207 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  43.79 
 
 
192 aa  144  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  41.48 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  41.53 
 
 
224 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  42.77 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  40.91 
 
 
194 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  42.2 
 
 
207 aa  143  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0619  guanylate kinase  43.01 
 
 
210 aa  143  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  44.38 
 
 
205 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  44.44 
 
 
207 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  43.58 
 
 
202 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  44.83 
 
 
230 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11910  guanylate kinase  45.86 
 
 
170 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000147119  normal  0.0183319 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  45.4 
 
 
202 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  44 
 
 
204 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  44.44 
 
 
186 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  41.04 
 
 
210 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  43.86 
 
 
209 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  39.66 
 
 
195 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  41.04 
 
 
210 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  42.63 
 
 
221 aa  141  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  41.04 
 
 
210 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>