More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2215 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  74.95 
 
 		 479 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 484 aa  962    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  70.52 
 
 		 483 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  70.52 
 
 		 483 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  70.74 
 
 		 483 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  68.97 
 
 		 495 aa  589  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  70.35 
 
 		 482 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  69.56 
 
 		 482 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  66.74 
 
 		 503 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  64.68 
 
 		 502 aa  555  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  64.06 
 
 		 512 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  67.48 
 
 		 486 aa  548  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  61.71 
 
 		 509 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  63.62 
 
 		 485 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  64.9 
 
 		 493 aa  541  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  63.13 
 
 		 482 aa  542  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  64.66 
 
 		 494 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  62.66 
 
 		 512 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  65.36 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  64.24 
 
 		 501 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  60.2 
 
 		 493 aa  528  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  62.86 
 
 		 521 aa  523  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  61.79 
 
 		 487 aa  523  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  61.32 
 
 		 553 aa  519  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  63.83 
 
 		 494 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  57.96 
 
 		 517 aa  512  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  64.25 
 
 		 493 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  63.56 
 
 		 515 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  61.92 
 
 		 522 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  64.43 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  62.3 
 
 		 515 aa  502  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  63.13 
 
 		 515 aa  500  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  62.86 
 
 		 546 aa  498  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  62.53 
 
 		 505 aa  495  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  60.78 
 
 		 530 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  61.59 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  55.73 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  54.81 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  44.76 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  45.33 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  42.06 
 
 		 437 aa  333  4e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  45.24 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  46.54 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  43.86 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  42.99 
 
 		 421 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  42 
 
 		 415 aa  313  5.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  41.93 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  45.73 
 
 		 417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  42.89 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  42.52 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  55.34 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  43.19 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.06 
 
 		 582 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.02 
 
 		 454 aa  302  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  43.42 
 
 		 461 aa  299  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  43.71 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  41.59 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  44.6 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  42.44 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  43.47 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  39.1 
 
 		 419 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  43.53 
 
 		 442 aa  296  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  41.21 
 
 		 420 aa  295  9e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  46.84 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  41.83 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  41.01 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  43.62 
 
 		 426 aa  294  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  39.34 
 
 		 419 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  44.06 
 
 		 432 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  44.35 
 
 		 553 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  44.3 
 
 		 432 aa  293  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  39.05 
 
 		 419 aa  293  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.37 
 
 		 426 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  43.1 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  38.86 
 
 		 419 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  38.86 
 
 		 419 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  43.1 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  43.1 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  39.47 
 
 		 419 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  38.81 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  41.28 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  38.86 
 
 		 419 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  40.05 
 
 		 420 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  42.96 
 
 		 440 aa  290  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  41.83 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  45.09 
 
 		 435 aa  289  8e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  38.86 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  38.86 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  41.92 
 
 		 596 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.33 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  42.03 
 
 		 428 aa  286  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  42.03 
 
 		 428 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  42.37 
 
 		 433 aa  286  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.33 
 
 		 429 aa  285  9e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  40.51 
 
 		 481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  42.03 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.51 
 
 		 441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  42.17 
 
 		 434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  40.34 
 
 		 401 aa  284  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  42.93 
 
 		 432 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>