61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0925 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  795    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  65.07 
 
 
384 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  63.83 
 
 
381 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  64.02 
 
 
385 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  63.47 
 
 
381 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  62.67 
 
 
383 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  62.67 
 
 
383 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  62.67 
 
 
383 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  61.93 
 
 
374 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  62.83 
 
 
382 aa  478  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  57.33 
 
 
386 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  64.02 
 
 
334 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  48.77 
 
 
375 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  35.44 
 
 
379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  33.93 
 
 
427 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  32.15 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  33.42 
 
 
485 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  33.98 
 
 
383 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  33.42 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  30 
 
 
381 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  31.23 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  33.24 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  35.62 
 
 
424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  32.9 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  33.42 
 
 
391 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  32.63 
 
 
397 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  32.88 
 
 
387 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  31.72 
 
 
388 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  30.4 
 
 
388 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  33.33 
 
 
409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  33.87 
 
 
390 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  31.18 
 
 
416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  31.42 
 
 
416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  31.42 
 
 
416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  30.5 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  32.8 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  33.06 
 
 
419 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  29.89 
 
 
411 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  28.41 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  33.52 
 
 
376 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  27.84 
 
 
429 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  28.5 
 
 
393 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  29.13 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  29.82 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  30.25 
 
 
423 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  30.77 
 
 
416 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  28.95 
 
 
389 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  28.95 
 
 
389 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  28.42 
 
 
389 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  28.84 
 
 
389 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  28.29 
 
 
403 aa  99.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  28.98 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  27.34 
 
 
388 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  25 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  26.16 
 
 
461 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  28.14 
 
 
360 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  24.48 
 
 
437 aa  59.7  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  21.98 
 
 
281 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3111  sulfotransferase  31.71 
 
 
329 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  25.85 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  23.63 
 
 
362 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>