101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0422 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  100 
 
 
127 aa  258  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  52.89 
 
 
123 aa  133  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  51.54 
 
 
128 aa  120  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  47.58 
 
 
126 aa  116  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  53.45 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  53.33 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  50 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  50.4 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  63.95 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  47.62 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  50.93 
 
 
123 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  45.53 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  45.97 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  44 
 
 
127 aa  97.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  51.19 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  41.27 
 
 
128 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  48.15 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  40.31 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  40.37 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  47.27 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  48.24 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.21 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  43.24 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  38.71 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  40 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0736  death-on-curing family protein  38.46 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  38.28 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  40.2 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  42.2 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  46.03 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  34.51 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  39.05 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  35.16 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  42.27 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  36.67 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  39.53 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  31.48 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  36.36 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  38.82 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  41.18 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  37.62 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  37.76 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  40 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  42.7 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  37.21 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  49.23 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  39.25 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  34.31 
 
 
336 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  36.05 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  36.54 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  36.36 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  41.84 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  33.72 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  39.24 
 
 
330 aa  52  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  38.3 
 
 
129 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  38.3 
 
 
129 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  32.48 
 
 
138 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  28.87 
 
 
140 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.88 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  34.78 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  32.33 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  41.67 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  37.63 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  36 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  34.15 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  30.43 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  42.86 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  32.22 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  30.89 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  30.89 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  38.46 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  42.65 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  43.94 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  35.71 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  43.64 
 
 
330 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  42.86 
 
 
324 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  42.86 
 
 
324 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  36.05 
 
 
131 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  41.07 
 
 
327 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  35.23 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  40.32 
 
 
328 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  36.36 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  40.32 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  46.81 
 
 
334 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.12 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  33.04 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1673  death-on-curing family protein  33.68 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.869011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  25.29 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  33.67 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  41.18 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  35.37 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  32.53 
 
 
332 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  30.68 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  38.03 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1701  hypothetical protein  39.68 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  38.18 
 
 
172 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  36.59 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>