More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2583 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 330 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  55.9 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  36.39 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  41.84 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  38.44 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  35.46 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  27.9 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5891  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  33.56 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  36.18 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 		 344 aa  132  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 305 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  30 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  30.77 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 455 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.25 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  28.14 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 1267 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  30.65 
 
 		 291 aa  92.8  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 282 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.56 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 722 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 489 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 1267 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 401 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 		 970 aa  85.9  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.98 
 
 		 700 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 1106 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.48 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  24.37 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  26.51 
 
 		 838 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  30.41 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  30.3 
 
 		 860 aa  79.3  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 1523 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 		 1523 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 703 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  29 
 
 		 616 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  25.9 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5047  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  23.45 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  26.85 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.63 
 
 		 1119 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>