More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2573 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 338 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  31.17 
 
 		 310 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 		 528 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 322 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  41.88 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 260 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.91 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  28.33 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  34.68 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.22 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  26.05 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 477 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1100  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 		 454 aa  75.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  26.43 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 884 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  38.02 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2765  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 626 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 924 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 		 444 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 		 812 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.52 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  42.27 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  40.86 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  27 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.07 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  36.81 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  28.09 
 
 		 300 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 1035 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>