More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1989 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 357 aa  710    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  88.29 
 
 		 371 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  52.56 
 
 		 361 aa  317  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  48.2 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  50.14 
 
 		 363 aa  298  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  46.2 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.13 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.93 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.28 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.47 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.57 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  28.25 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  25.97 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  31.15 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  28.66 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.49 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.99 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  29.71 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  31.67 
 
 		 365 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  31.39 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  31.12 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 347 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.71 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.98 
 
 		 343 aa  99.4  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.2 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0610  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  29.1 
 
 		 386 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  28.7 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  27.25 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  29.6 
 
 		 356 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.32 
 
 		 359 aa  96.3  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.95 
 
 		 368 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  26.45 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  27.43 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  28.66 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  24.93 
 
 		 367 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  28.49 
 
 		 350 aa  92.8  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  25.8 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0618  glycosyl transferase family 9  25.75 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.06 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.27 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  30.98 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.27 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0634  glycosyl transferase family 9  25.75 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  27.81 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.98 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  26.73 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.97 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.23 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2415  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000869235  hitchhiker  0.0000149362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  27.73 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.93 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  26.1 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.09 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  26.1 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 403 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1574  glycosyl transferase family 9  27.68 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  27.46 
 
 		 335 aa  87  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.82 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  29.7 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  26.48 
 
 		 349 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0357  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.89 
 
 		 324 aa  85.9  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0363758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.7 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.66 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.66 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.72 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.19 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.66 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.19 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.66 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.19 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.66 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.7 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.19 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.69 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.69 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  29.11 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.57 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.19 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  25.85 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0465  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  25.85 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.51 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>