48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1195 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  837    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  87.84 
 
 		 396 aa  736    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  48.44 
 
 		 390 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  40 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  39.6 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  44.28 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  40.46 
 
 		 421 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  37.54 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  40 
 
 		 401 aa  209  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  39.11 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  36.89 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  38.91 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  36.14 
 
 		 394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  39.53 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  37.78 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  38.79 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  38.44 
 
 		 397 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  34.42 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  36.67 
 
 		 386 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  30.61 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  35.69 
 
 		 388 aa  152  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  33.14 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  32.24 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  30.11 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  30.71 
 
 		 394 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  30.43 
 
 		 394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  30.27 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.1 
 
 		 545 aa  142  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  31.35 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  31.92 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  32.29 
 
 		 379 aa  136  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  32.36 
 
 		 409 aa  129  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  30 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  31.19 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  30.12 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  32.2 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  28.7 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  31.42 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  28.7 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  28.45 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  24.71 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  24.48 
 
 		 358 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  28.85 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  26.38 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  28.41 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  29.17 
 
 		 119 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>