289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3531 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
177 aa  359  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  82.39 
 
 
159 aa  269  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  71.26 
 
 
167 aa  244  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  71.26 
 
 
167 aa  244  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  72.33 
 
 
159 aa  236  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  72.33 
 
 
159 aa  236  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  72.33 
 
 
159 aa  236  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  72.33 
 
 
159 aa  236  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  72.33 
 
 
159 aa  236  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  72.33 
 
 
159 aa  236  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  71.7 
 
 
159 aa  235  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  71.7 
 
 
159 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  69.81 
 
 
159 aa  231  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  63.69 
 
 
159 aa  202  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 
159 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 
159 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  61.78 
 
 
159 aa  191  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  61.78 
 
 
159 aa  191  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  59.75 
 
 
159 aa  191  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  57.23 
 
 
159 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  57.5 
 
 
160 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
159 aa  186  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  186  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  57.23 
 
 
159 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  59.24 
 
 
159 aa  180  7e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  180  9.000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  56.6 
 
 
159 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  54.09 
 
 
159 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 
159 aa  178  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  55.41 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  52.23 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  53.99 
 
 
160 aa  173  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  54.09 
 
 
159 aa  170  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  53.12 
 
 
160 aa  169  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  55 
 
 
160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  52.2 
 
 
159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  50.3 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  51.25 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  49.04 
 
 
159 aa  160  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  49.68 
 
 
156 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  48.7 
 
 
159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  47.17 
 
 
158 aa  142  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  45.62 
 
 
159 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  40.65 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  51.7 
 
 
155 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  43.95 
 
 
159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  45.22 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  43.12 
 
 
150 aa  122  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  42.41 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  40.76 
 
 
156 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  39.75 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 
157 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  43.4 
 
 
153 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  40.88 
 
 
152 aa  114  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  38.99 
 
 
145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  42.5 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  39.1 
 
 
154 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  39.24 
 
 
157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
162 aa  111  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  37.11 
 
 
156 aa  111  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  36.65 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  35.98 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  36.08 
 
 
154 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  36.54 
 
 
157 aa  107  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  37.18 
 
 
153 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  40.13 
 
 
153 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  38.27 
 
 
160 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  40.76 
 
 
153 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
156 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  35.44 
 
 
154 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 
155 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  34.39 
 
 
155 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  41.25 
 
 
157 aa  104  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  40.13 
 
 
153 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  40.13 
 
 
154 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
162 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  35.85 
 
 
155 aa  103  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  33.96 
 
 
155 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 
157 aa  102  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0119  protein of unknown function DUF163  39.87 
 
 
142 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  53.57 
 
 
84 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
155 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 
155 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  37.58 
 
 
152 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  35.67 
 
 
154 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 
155 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 
156 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  101  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
156 aa  101  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 
157 aa  101  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  35.26 
 
 
157 aa  101  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
155 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 
157 aa  101  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  35.22 
 
 
157 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 
156 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>