More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2083 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2083  recA protein  100 
 
 		 277 aa  564  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1190  recA protein  90.31 
 
 		 283 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000832265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  89.22 
 
 		 343 aa  346  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  85.85 
 
 		 343 aa  343  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  78.16 
 
 		 355 aa  343  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  86.67 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  87.08 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  84.58 
 
 		 343 aa  342  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  84.58 
 
 		 343 aa  342  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  76.5 
 
 		 347 aa  341  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  76.5 
 
 		 347 aa  341  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  76.74 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  74.3 
 
 		 341 aa  338  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  72.02 
 
 		 364 aa  328  5.0000000000000004e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  72.68 
 
 		 347 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  69.72 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  68.02 
 
 		 352 aa  317  9e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  71.22 
 
 		 352 aa  318  9e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  78.33 
 
 		 349 aa  317  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  68.2 
 
 		 357 aa  316  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  72.2 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  72.95 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  72.95 
 
 		 364 aa  316  3e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  78.5 
 
 		 346 aa  314  9e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  67.74 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  69.27 
 
 		 365 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  65.45 
 
 		 350 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  67.8 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  70.35 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  66.36 
 
 		 358 aa  305  6e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  69.27 
 
 		 350 aa  305  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  68.29 
 
 		 347 aa  304  9.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  67.8 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  67.82 
 
 		 335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  65.42 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  65.85 
 
 		 418 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  67.31 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  68.78 
 
 		 347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  66.97 
 
 		 376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  66.83 
 
 		 367 aa  302  4.0000000000000003e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  67.31 
 
 		 345 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  67.32 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  70 
 
 		 347 aa  301  6.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  66.99 
 
 		 361 aa  301  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  68.29 
 
 		 345 aa  301  7.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  68.29 
 
 		 348 aa  301  8.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  63.04 
 
 		 344 aa  300  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  67.32 
 
 		 359 aa  300  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  67.32 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  63.9 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  67.32 
 
 		 350 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  67.32 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  67.32 
 
 		 366 aa  299  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  68.75 
 
 		 379 aa  299  3e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  65.44 
 
 		 338 aa  299  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  65.44 
 
 		 338 aa  299  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  68.29 
 
 		 363 aa  298  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  66.83 
 
 		 376 aa  298  6e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  70.77 
 
 		 336 aa  298  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  66.83 
 
 		 368 aa  298  7e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  66.35 
 
 		 378 aa  298  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  71.14 
 
 		 346 aa  297  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  66.34 
 
 		 345 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  65.85 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  65.42 
 
 		 349 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  59.43 
 
 		 347 aa  296  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  68.84 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  66.83 
 
 		 362 aa  295  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  63 
 
 		 363 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  68.84 
 
 		 348 aa  295  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  65.85 
 
 		 347 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  65.85 
 
 		 347 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  65.85 
 
 		 347 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  66.83 
 
 		 358 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  65.37 
 
 		 345 aa  295  8e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  62.62 
 
 		 352 aa  295  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  64.25 
 
 		 363 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  65.85 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  66.5 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  71.08 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  66.02 
 
 		 358 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  66.83 
 
 		 358 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  64.39 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  65.37 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  64.09 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  61.75 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  63.35 
 
 		 363 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  67.15 
 
 		 364 aa  292  4e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  63.13 
 
 		 360 aa  292  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  62.44 
 
 		 364 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  64.25 
 
 		 362 aa  291  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  67.31 
 
 		 379 aa  291  6e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  66.18 
 
 		 365 aa  291  7e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  63.01 
 
 		 343 aa  291  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  65.85 
 
 		 358 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  65.22 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  70.87 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  64.73 
 
 		 352 aa  289  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  65.53 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  65.37 
 
 		 356 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>