More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1190 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1190  recA protein  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000832265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2083  recA protein  90.31 
 
 		 277 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  85.19 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  80.6 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  87.29 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  87.29 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  87.29 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  83.47 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  87.93 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  76.54 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  76.79 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  72.47 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  75 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  76.79 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  69.88 
 
 		 352 aa  371  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  69.88 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  71.91 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  75.31 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  71.67 
 
 		 362 aa  363  2e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  71.98 
 
 		 348 aa  360  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  76.96 
 
 		 349 aa  358  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  73.57 
 
 		 343 aa  358  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  66.28 
 
 		 364 aa  355  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  67.32 
 
 		 385 aa  352  4e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  69.96 
 
 		 357 aa  351  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  67.47 
 
 		 347 aa  348  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  65.2 
 
 		 350 aa  348  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  64.2 
 
 		 341 aa  348  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  65.74 
 
 		 350 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  66.81 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  68.97 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  65.74 
 
 		 358 aa  346  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  70.94 
 
 		 376 aa  346  3e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  68.53 
 
 		 367 aa  345  6e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  67.67 
 
 		 361 aa  344  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  65.52 
 
 		 379 aa  344  8.999999999999999e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  69.83 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  69.49 
 
 		 379 aa  343  1e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  66.94 
 
 		 347 aa  343  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  66.67 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  68.05 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  66.4 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  69.6 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  65.84 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  66.53 
 
 		 345 aa  342  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  66.81 
 
 		 366 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  69.3 
 
 		 347 aa  342  4e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  66.39 
 
 		 350 aa  342  4e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  68.53 
 
 		 359 aa  342  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  68.53 
 
 		 378 aa  342  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  67.24 
 
 		 368 aa  342  5e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  68.53 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  66.39 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  65.02 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  68.97 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  68.1 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  66.25 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  67.7 
 
 		 344 aa  339  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  67.8 
 
 		 363 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  69.03 
 
 		 338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  65.02 
 
 		 352 aa  339  2.9999999999999998e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  68.53 
 
 		 349 aa  339  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  67.24 
 
 		 364 aa  339  2.9999999999999998e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  66.95 
 
 		 357 aa  338  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  69.03 
 
 		 338 aa  338  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  64.61 
 
 		 348 aa  338  5e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  68.22 
 
 		 379 aa  338  5.9999999999999996e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  70.72 
 
 		 336 aa  337  9e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  69.47 
 
 		 348 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  69.47 
 
 		 348 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  67.95 
 
 		 358 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  71.3 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  67.09 
 
 		 358 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  67.24 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  67.84 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  67.24 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  66.95 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  67.24 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  64.4 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  67.24 
 
 		 383 aa  335  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  64.4 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  66.81 
 
 		 346 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  65.94 
 
 		 335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  64.4 
 
 		 356 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  66.08 
 
 		 343 aa  335  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  71 
 
 		 345 aa  335  5e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  66.38 
 
 		 345 aa  335  5e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  67.24 
 
 		 363 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  67.4 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  64.1 
 
 		 390 aa  334  9e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  66.81 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  64.26 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  64.26 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  64.26 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  66.81 
 
 		 362 aa  333  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  64.26 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  64.26 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  64.32 
 
 		 343 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  66.81 
 
 		 363 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  64.26 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>