More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0127 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  75.69 
 
 
433 aa  670    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
430 aa  851    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  75.69 
 
 
433 aa  670    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  75.69 
 
 
433 aa  670    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  75.69 
 
 
433 aa  670    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  69.84 
 
 
434 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  70.3 
 
 
434 aa  634    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  92.33 
 
 
430 aa  771    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  75.69 
 
 
433 aa  670    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  75.93 
 
 
433 aa  671    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  75.46 
 
 
433 aa  670    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  75.69 
 
 
433 aa  670    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  76.85 
 
 
433 aa  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  75.93 
 
 
433 aa  671    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  69.84 
 
 
434 aa  632  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  69.61 
 
 
434 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  69.61 
 
 
434 aa  633  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  69.37 
 
 
434 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  69.37 
 
 
434 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  69.37 
 
 
434 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  69.37 
 
 
434 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  69.61 
 
 
434 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  70.3 
 
 
434 aa  609  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0142  preprotein translocase, SecY subunit  74.13 
 
 
355 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.58947e-61 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  58.37 
 
 
430 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  58.37 
 
 
430 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  58.1 
 
 
430 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  50.8 
 
 
434 aa  432  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  50.8 
 
 
438 aa  422  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  49.77 
 
 
431 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  48.97 
 
 
439 aa  421  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  51.28 
 
 
420 aa  408  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  49.08 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  50.11 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  50.12 
 
 
424 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  51.74 
 
 
419 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0310  preprotein translocase subunit SecY  48.05 
 
 
431 aa  392  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  8.823840000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  48.26 
 
 
419 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 
419 aa  388  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 
421 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  46.91 
 
 
435 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  47.22 
 
 
418 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  47.47 
 
 
421 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  45.23 
 
 
435 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  48.39 
 
 
447 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  44.87 
 
 
435 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 
435 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  48.64 
 
 
447 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.26 
 
 
448 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.68 
 
 
444 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  45.1 
 
 
435 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  44.27 
 
 
435 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  44.09 
 
 
435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 
437 aa  362  9e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  45.91 
 
 
430 aa  361  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  44.19 
 
 
435 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  48.05 
 
 
447 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  44.82 
 
 
448 aa  359  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  45.68 
 
 
429 aa  359  7e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  44.5 
 
 
426 aa  358  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.84 
 
 
445 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  48.98 
 
 
422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.83 
 
 
442 aa  355  8.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.37 
 
 
428 aa  353  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  47.07 
 
 
427 aa  352  7e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  43.9 
 
 
434 aa  351  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  44.78 
 
 
446 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  44.39 
 
 
437 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  46.24 
 
 
441 aa  350  4e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 
437 aa  349  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  43.49 
 
 
442 aa  348  8e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  43.49 
 
 
429 aa  348  9e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  44.5 
 
 
437 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  43.95 
 
 
443 aa  346  6e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  44.62 
 
 
438 aa  346  6e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  43.88 
 
 
448 aa  345  7e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  44.13 
 
 
439 aa  345  7e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  41.84 
 
 
443 aa  345  8e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  43.09 
 
 
443 aa  345  8e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  44.66 
 
 
445 aa  345  8e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  43.46 
 
 
446 aa  345  8e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  43.22 
 
 
446 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  43.08 
 
 
446 aa  345  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  43.17 
 
 
436 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  43.59 
 
 
446 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  43.52 
 
 
436 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  44.34 
 
 
448 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.87 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  43.19 
 
 
446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  45.77 
 
 
428 aa  343  4e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  42.92 
 
 
444 aa  343  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  41.46 
 
 
437 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  42.69 
 
 
427 aa  341  1e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
443 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  42.95 
 
 
435 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  42.72 
 
 
443 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  42.72 
 
 
443 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 
443 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 
443 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  43.39 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>