More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3119 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3119  integral membrane protein MviN  100 
 
 
507 aa  1014    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  29.64 
 
 
534 aa  173  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.85 
 
 
523 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  25.3 
 
 
524 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  25.73 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  24.85 
 
 
523 aa  144  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  24.44 
 
 
533 aa  143  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  28.21 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  26.3 
 
 
514 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  27.4 
 
 
521 aa  128  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  24.86 
 
 
529 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  26.27 
 
 
520 aa  126  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  24.81 
 
 
526 aa  126  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  27.35 
 
 
531 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  26 
 
 
530 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  23.58 
 
 
518 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  26.9 
 
 
521 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  23.79 
 
 
512 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  26.9 
 
 
516 aa  123  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  26.23 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  25.72 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  23.75 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  26.78 
 
 
517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  24.2 
 
 
494 aa  120  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  25.79 
 
 
511 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  25.36 
 
 
521 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  24.9 
 
 
517 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  25 
 
 
522 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  24.9 
 
 
517 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  25.77 
 
 
530 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  25.16 
 
 
511 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  26.44 
 
 
518 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  25.51 
 
 
573 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  24.35 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 
515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  24.5 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.83 
 
 
613 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  26.17 
 
 
545 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  25.91 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  25.57 
 
 
521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  24.16 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  26.87 
 
 
521 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  24.59 
 
 
523 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  25 
 
 
512 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  25 
 
 
534 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  25 
 
 
512 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  24.25 
 
 
542 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  24.25 
 
 
511 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  23.34 
 
 
508 aa  108  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  23.81 
 
 
524 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  23.81 
 
 
524 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  23.81 
 
 
524 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  23.81 
 
 
524 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  23.81 
 
 
524 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  23.47 
 
 
495 aa  107  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  25.25 
 
 
525 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1607  integral membrane protein MviN  26.77 
 
 
469 aa  106  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.916233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 
512 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  25.42 
 
 
512 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  25.6 
 
 
517 aa  106  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  24.62 
 
 
531 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  24.9 
 
 
526 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  24.88 
 
 
513 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  24 
 
 
511 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0625  virulence factor MVIN family protein  27.53 
 
 
448 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.289297  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1370  integral membrane protein MviN  22.84 
 
 
512 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000411577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 
541 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  23.15 
 
 
519 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  23.47 
 
 
512 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  24.87 
 
 
556 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 
548 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 
517 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  24.53 
 
 
511 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  23.83 
 
 
511 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  24.9 
 
 
549 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 
511 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 
511 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 
511 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 
535 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 
535 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 
511 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  26.06 
 
 
516 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 
511 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  24.82 
 
 
535 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  26.38 
 
 
498 aa  103  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  24.88 
 
 
511 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  24.88 
 
 
511 aa  103  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  24.88 
 
 
511 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  24.88 
 
 
511 aa  103  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  23.12 
 
 
528 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  23 
 
 
523 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  25.1 
 
 
497 aa  103  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  24.66 
 
 
516 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  24.51 
 
 
528 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 
513 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0865  virulence factor MVIN family protein  25.9 
 
 
444 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156001  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  26.29 
 
 
521 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  24.88 
 
 
516 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  25 
 
 
521 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  23.47 
 
 
512 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>