More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0484 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  47.35 
 
 		 1510 aa  1347    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  65.95 
 
 		 1478 aa  2008    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  65.55 
 
 		 1478 aa  2001    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  65.61 
 
 		 1478 aa  2004    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  65.68 
 
 		 1478 aa  2006    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  65.3 
 
 		 1478 aa  2023    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.53 
 
 		 1510 aa  1148    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  46.65 
 
 		 1513 aa  1283    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  47.75 
 
 		 1510 aa  1340    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  65.61 
 
 		 1478 aa  2004    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  49.3 
 
 		 1498 aa  1390    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  66.04 
 
 		 1478 aa  2009    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  65.95 
 
 		 1478 aa  2008    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  65.55 
 
 		 1478 aa  2006    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  100 
 
 		 1505 aa  3107    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  65.84 
 
 		 1478 aa  2008    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.85 
 
 		 1519 aa  1170    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  49.87 
 
 		 1499 aa  1345    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  48.51 
 
 		 1507 aa  1346    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  47.68 
 
 		 1507 aa  1308    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  66 
 
 		 1477 aa  2028    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  49.14 
 
 		 1518 aa  1381    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  31.6 
 
 		 1486 aa  575  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  31.4 
 
 		 1481 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  31.56 
 
 		 1487 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  31.67 
 
 		 1507 aa  565  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3508  glutamate synthase subunit alpha  31.6 
 
 		 1517 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  32.17 
 
 		 1486 aa  562  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  31.28 
 
 		 1487 aa  562  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.22 
 
 		 1487 aa  563  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  31.32 
 
 		 1486 aa  562  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  31.22 
 
 		 1482 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.02 
 
 		 1486 aa  562  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  31.37 
 
 		 1482 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  31.44 
 
 		 1482 aa  562  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  31.81 
 
 		 1482 aa  562  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  31.15 
 
 		 1482 aa  563  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03077  glutamate synthase, large subunit  31.6 
 
 		 1517 aa  559  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.427677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0495  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.6 
 
 		 1517 aa  560  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  31.6 
 
 		 1486 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4535  glutamate synthase subunit alpha  31.53 
 
 		 1517 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3405  glutamate synthase subunit alpha  31.6 
 
 		 1486 aa  559  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3700  glutamate synthase subunit alpha  31.6 
 
 		 1486 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  31.63 
 
 		 1482 aa  560  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3558  glutamate synthase subunit alpha  31.62 
 
 		 1486 aa  558  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  31.17 
 
 		 1482 aa  560  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  31.37 
 
 		 1482 aa  559  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0488  glutamate synthase subunit alpha  31.67 
 
 		 1522 aa  559  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.690727 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03028  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1517 aa  559  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.403109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  31.17 
 
 		 1482 aa  556  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  30.64 
 
 		 1483 aa  556  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  31.6 
 
 		 1486 aa  555  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  31.33 
 
 		 1482 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  31.13 
 
 		 1482 aa  550  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  31.25 
 
 		 1486 aa  551  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.49 
 
 		 1554 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  31.5 
 
 		 1462 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  31.49 
 
 		 1482 aa  551  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  30.01 
 
 		 1480 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  31.38 
 
 		 1482 aa  552  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  30.15 
 
 		 1460 aa  548  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0411  glutamate synthase subunit alpha  30.34 
 
 		 1481 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2767  glutamate synthase subunit alpha  30.86 
 
 		 1494 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  29.8 
 
 		 1481 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.36 
 
 		 1487 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  31.37 
 
 		 1462 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  31.12 
 
 		 1488 aa  547  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  31.13 
 
 		 1482 aa  550  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  30.24 
 
 		 1486 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  31.29 
 
 		 1483 aa  549  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3656  glutamate synthase subunit alpha  30.62 
 
 		 1516 aa  549  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.166032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  30.61 
 
 		 1485 aa  546  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3033  glutamate synthase subunit alpha  31.02 
 
 		 1485 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  30.13 
 
 		 1482 aa  545  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1957  glutamate synthase subunit alpha  30.33 
 
 		 1493 aa  544  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  30.66 
 
 		 1535 aa  544  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  31.16 
 
 		 1484 aa  546  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.11 
 
 		 1554 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  30.61 
 
 		 1485 aa  546  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  30.21 
 
 		 1481 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  30.31 
 
 		 1481 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.79 
 
 		 1468 aa  536  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  30.17 
 
 		 1481 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  31.38 
 
 		 1477 aa  538  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  31.31 
 
 		 1489 aa  538  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  29.37 
 
 		 1510 aa  539  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  30.36 
 
 		 1491 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  31.63 
 
 		 1461 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000785816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  29.95 
 
 		 1571 aa  531  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.8 
 
 		 1469 aa  532  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.65 
 
 		 1572 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  29.85 
 
 		 1481 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  30.06 
 
 		 1516 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3317  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.05 
 
 		 1574 aa  530  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.59 
 
 		 1511 aa  529  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.51 
 
 		 1474 aa  529  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  29.95 
 
 		 1562 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  29.73 
 
 		 1481 aa  530  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  30.59 
 
 		 1572 aa  528  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  29.4 
 
 		 1481 aa  529  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>