208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0439 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1947  methyl-accepting/DNA response regulator, putative  50.69 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1977  putative methyl-accepting/DNA response regulator  50.69 
 
 		 214 aa  228  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1862  putative methyl-accepting/DNA response regulator  50.69 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1703  transcriptional regulatory protein  51.15 
 
 		 214 aa  228  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3480  putative methyl-accepting/DNA response regulator  50.69 
 
 		 214 aa  227  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0914796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1725  methyl-accepting/DNA response regulator  50.23 
 
 		 214 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1899  putative methyl-accepting/DNA response regulator  50.23 
 
 		 214 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1861  methyl-accepting/DNA response regulator  50.23 
 
 		 214 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1677  transcriptional regulatory protein  50.23 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  43.93 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  42.99 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  42.99 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  42.99 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  47.31 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  42.99 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  41.51 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  41.51 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  42.99 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.266934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0121364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  36.73 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.73 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  36.73 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  36.73 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  36.73 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  36.73 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  36.73 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.1 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.2 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  37.76 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  37.76 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.76 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0116  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.41 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  37.76 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.14 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.2 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4386  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.76 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.1 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.27 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.72 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  27.05 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  31.73 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  29.17 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.47 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2673  ABC transporter related protein  29.35 
 
 		 330 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.18 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.77 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 373 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  28.41 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  32.73 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.18 
 
 		 273 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2099  sensory box protein, putative  30.59 
 
 		 232 aa  51.6  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.374789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.9 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  28.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  28.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.9 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3926  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.91 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.9 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.85 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.88 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.71 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.88 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.88 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.88 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  31.52 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.85 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0428  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.18 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.472628  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.88 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3000  response regulator receiver domain-containing protein  27.08 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.02 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.874782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.57 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  32.61 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5406  ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 335 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.3143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5544  ABC transporter, ATP-binding protein  25.89 
 
 		 335 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000378765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  26.21 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>