More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3429 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3429  NADH dehydrogenase I, N subunit  100 
 
 
466 aa  885    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0172  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  84.76 
 
 
466 aa  698    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0313  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  62.9 
 
 
469 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0148  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.53 
 
 
463 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0166  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50 
 
 
464 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.93111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.92 
 
 
484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.13 
 
 
484 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.08 
 
 
487 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.36 
 
 
487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  38.78 
 
 
484 aa  276  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.29 
 
 
484 aa  276  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.73 
 
 
489 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.71 
 
 
498 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.31 
 
 
491 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0216  NADH dehydrogenase I chain N  44.8 
 
 
464 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.69 
 
 
476 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.14 
 
 
483 aa  253  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  41.31 
 
 
531 aa  250  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  39.95 
 
 
488 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  36.05 
 
 
478 aa  249  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.04 
 
 
477 aa  249  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.82 
 
 
477 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  39.69 
 
 
488 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  36.26 
 
 
478 aa  246  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  37.81 
 
 
480 aa  247  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  34.92 
 
 
476 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.74 
 
 
483 aa  246  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.4 
 
 
482 aa  246  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  38.58 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  38.58 
 
 
488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  37.5 
 
 
485 aa  244  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  37.41 
 
 
482 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  37.5 
 
 
485 aa  244  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  38.58 
 
 
488 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  38.58 
 
 
488 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  40.52 
 
 
489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  40.76 
 
 
489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  40.76 
 
 
489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  40.52 
 
 
489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  38.74 
 
 
479 aa  243  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.06 
 
 
476 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.95 
 
 
481 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.46 
 
 
500 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.36 
 
 
479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.06 
 
 
489 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  36.67 
 
 
482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.32 
 
 
498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.67 
 
 
492 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  38.13 
 
 
491 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0791  NADH dehydrogenase subunit N  34.89 
 
 
487 aa  239  5.999999999999999e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.112616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  39.38 
 
 
487 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  38.62 
 
 
494 aa  239  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.47 
 
 
482 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
485 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.71 
 
 
479 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  39.79 
 
 
524 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.71 
 
 
479 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.59 
 
 
478 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  39.53 
 
 
524 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  39.53 
 
 
524 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
490 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
490 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
490 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.47 
 
 
476 aa  236  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
490 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.93 
 
 
482 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  37.55 
 
 
479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  37.25 
 
 
492 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  37.13 
 
 
478 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  38.62 
 
 
478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  36.25 
 
 
490 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  38.62 
 
 
478 aa  233  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.22 
 
 
457 aa  233  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.85 
 
 
479 aa  233  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  35.11 
 
 
481 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0854  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.75 
 
 
511 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  39.15 
 
 
497 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  35.57 
 
 
479 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  36.25 
 
 
490 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  37.95 
 
 
527 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  37.11 
 
 
494 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  35.07 
 
 
478 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  38.73 
 
 
493 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.26 
 
 
480 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  0.0278862 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.27 
 
 
481 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  38.27 
 
 
481 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.9 
 
 
488 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  40.65 
 
 
531 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2552  NADH dehydrogenase subunit N  38.56 
 
 
478 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  35.96 
 
 
481 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.85 
 
 
481 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  36.05 
 
 
481 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  35.83 
 
 
479 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  37.63 
 
 
489 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.35 
 
 
505 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1935  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.48 
 
 
472 aa  225  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.758736  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  37.42 
 
 
489 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>