More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0216 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0216  NADH dehydrogenase I chain N  100 
 
 		 464 aa  886    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0313  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.04 
 
 		 469 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3429  NADH dehydrogenase I, N subunit  44.03 
 
 		 466 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0172  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.55 
 
 		 466 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.27 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.62 
 
 		 476 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  38.16 
 
 		 484 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.97 
 
 		 476 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.5 
 
 		 484 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.03 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.38 
 
 		 487 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.25 
 
 		 484 aa  236  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.98 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  33.19 
 
 		 482 aa  233  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  32.97 
 
 		 482 aa  229  9e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  39.53 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.4 
 
 		 478 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  35.86 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  39.53 
 
 		 485 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.68 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.33 
 
 		 489 aa  226  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  38.7 
 
 		 531 aa  225  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.95 
 
 		 479 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  34.77 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.16 
 
 		 475 aa  223  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3741  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.01 
 
 		 496 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  35.04 
 
 		 485 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01300  NADH dehydrogenase subunit N  35.68 
 
 		 487 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  37.18 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  35.29 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  35.29 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  35.29 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  35.29 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  35.29 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.56 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  35.29 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  35.29 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.03 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  34.35 
 
 		 478 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0987  NADH dehydrogenase subunit N  40.29 
 
 		 566 aa  216  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  36.77 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  34.95 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1196  NADH dehydrogenase subunit N  35.75 
 
 		 483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  36.91 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  33.05 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  34.66 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0760  NADH dehydrogenase subunit N  37.3 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.35 
 
 		 498 aa  213  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2818  NADH dehydrogenase subunit N  36.07 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  33.8 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.15 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.36 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0166  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.58 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.93111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.13 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.04 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  34.86 
 
 		 488 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  34.86 
 
 		 488 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  35.66 
 
 		 494 aa  209  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  35.73 
 
 		 475 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.03 
 
 		 483 aa  209  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  35.75 
 
 		 481 aa  209  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  35.75 
 
 		 481 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.29 
 
 		 477 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.11 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.45 
 
 		 477 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  37.1 
 
 		 527 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.04 
 
 		 479 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4991  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.35 
 
 		 539 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162139  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0791  NADH dehydrogenase subunit N  37.33 
 
 		 487 aa  207  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.112616  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.22 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  38.48 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  38.48 
 
 		 489 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  39.05 
 
 		 489 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  33.4 
 
 		 478 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  34.22 
 
 		 485 aa  207  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.04 
 
 		 479 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  36.52 
 
 		 478 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  36.52 
 
 		 478 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  34.9 
 
 		 478 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.04 
 
 		 479 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.83 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  37.83 
 
 		 489 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  33.84 
 
 		 490 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.27 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  37.11 
 
 		 489 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  35.14 
 
 		 478 aa  206  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  35.14 
 
 		 478 aa  206  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  33.76 
 
 		 489 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  33.9 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  34.92 
 
 		 478 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  38.81 
 
 		 489 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  34.44 
 
 		 488 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0148  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.99 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  36.13 
 
 		 483 aa  205  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  34.44 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  37.01 
 
 		 524 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  33.84 
 
 		 490 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  34.44 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  37.01 
 
 		 524 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  38 
 
 		 487 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>