More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1299 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  100 
 
 		 164 aa  329  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  95.73 
 
 		 164 aa  315  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  96.05 
 
 		 164 aa  295  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  69.51 
 
 		 178 aa  228  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  68.9 
 
 		 164 aa  221  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  66.88 
 
 		 163 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  67.31 
 
 		 157 aa  217  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  66.24 
 
 		 169 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  63.69 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  60.98 
 
 		 164 aa  202  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  60.98 
 
 		 164 aa  202  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  54.88 
 
 		 167 aa  194  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  56.05 
 
 		 171 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  55.13 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  54.49 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  53.46 
 
 		 181 aa  184  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  57.24 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  52.87 
 
 		 173 aa  173  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  50.31 
 
 		 161 aa  168  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  52.05 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  51.01 
 
 		 163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  50 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  50.62 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  50.34 
 
 		 169 aa  158  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  44.23 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  49.67 
 
 		 194 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  49.67 
 
 		 194 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  49.67 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  46.84 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  44.81 
 
 		 171 aa  140  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  47.18 
 
 		 179 aa  141  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  40.38 
 
 		 185 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  41.14 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  40.79 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  41.4 
 
 		 176 aa  137  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  48 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  45.89 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  40.25 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  46.15 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  45.14 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.91 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  40.56 
 
 		 183 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  39.86 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  37.82 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  40.14 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  38.51 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  38.67 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  39.74 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  37.34 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  41.78 
 
 		 205 aa  123  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  43.26 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  44 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  48.48 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  39.33 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  39.49 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  41.18 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  39.49 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  43.95 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  43.95 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  40.97 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  48.09 
 
 		 191 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  48.09 
 
 		 191 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  39.86 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  37.84 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  38.1 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  39.86 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  40.26 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  35.26 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  37.5 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  38.26 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  37.58 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  40.94 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  36.77 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  38 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  41.26 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  34.84 
 
 		 183 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  42 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  37.11 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  35.67 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  37.67 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  38.36 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  37.11 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  37.11 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  38.96 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  37.11 
 
 		 171 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  37.16 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.78 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  39.86 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  35.62 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  39.07 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  36.84 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  36.84 
 
 		 218 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  37.5 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  38.36 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  38.36 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  37.91 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  37.5 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  38.36 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  36.13 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>