More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1640 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  100 
 
 		 287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  72.82 
 
 		 287 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  67.37 
 
 		 288 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  60.33 
 
 		 304 aa  355  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  58.6 
 
 		 303 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  51.77 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  51.77 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  52.04 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 367 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  51.38 
 
 		 326 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  45.08 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  46.92 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  46.32 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  51.22 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  51.22 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  47.47 
 
 		 325 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  47.3 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  36.63 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  38.76 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  38.24 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  42.67 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1062  ABC transporter-like protein protein  38.21 
 
 		 326 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124744  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  42.54 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  39.72 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  43.93 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  40.44 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  44.24 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  37.72 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  42.99 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 241 aa  185  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  36.72 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  42.52 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  42.52 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  44.91 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  38.6 
 
 		 311 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  43.23 
 
 		 298 aa  181  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  37.8 
 
 		 301 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  39.21 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.67 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  42.02 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  36.69 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 		 241 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  42.29 
 
 		 236 aa  178  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.92 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  37.65 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  38.2 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  39.17 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  41.05 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  42.65 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  34.09 
 
 		 341 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  35.48 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  42.06 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  45.32 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  35.81 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  36.27 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  39.25 
 
 		 308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  43.28 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  32.46 
 
 		 308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  37.33 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.05 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  33.86 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  44.55 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  39.06 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  31.75 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  42.5 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  39.91 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 335 aa  169  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  40.17 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 390 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  39.82 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  40.17 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>