37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0282 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 1381 aa  2734    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  77.51 
 
 		 1334 aa  1937    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  41.96 
 
 		 287 aa  151  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  31.41 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  39.02 
 
 		 484 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  29.78 
 
 		 3121 aa  63.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  29.05 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  29.76 
 
 		 453 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  29.76 
 
 		 453 aa  56.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  31.61 
 
 		 446 aa  56.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1324  hypothetical protein  31.94 
 
 		 231 aa  56.2  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.311232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  26.7 
 
 		 586 aa  55.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  28.05 
 
 		 235 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  31.03 
 
 		 453 aa  53.5  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  35.48 
 
 		 548 aa  53.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  31.13 
 
 		 664 aa  52.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  31.68 
 
 		 448 aa  52  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  31.68 
 
 		 448 aa  52  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  29.89 
 
 		 453 aa  52  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  31.68 
 
 		 448 aa  52  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  31.71 
 
 		 454 aa  52  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  31.71 
 
 		 454 aa  52  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  32.82 
 
 		 543 aa  51.6  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  31.71 
 
 		 454 aa  52  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  31.71 
 
 		 454 aa  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  30.82 
 
 		 348 aa  51.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  31.1 
 
 		 454 aa  51.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  26.59 
 
 		 378 aa  50.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  29.89 
 
 		 453 aa  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  29.89 
 
 		 453 aa  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  31.01 
 
 		 1237 aa  49.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  32.99 
 
 		 591 aa  48.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  27.48 
 
 		 317 aa  47.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  33.61 
 
 		 394 aa  46.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1272 aa  45.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  29.82 
 
 		 568 aa  45.1  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>