More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7215 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7215  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
212 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3669  flavin reductase domain-containing protein  67.1 
 
 
207 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  48.42 
 
 
197 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0350  flavin reductase domain-containing protein  46.15 
 
 
169 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2919  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  50.32 
 
 
178 aa  134  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  normal  0.385823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1979  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  51.97 
 
 
166 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.96 
 
 
171 aa  131  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2298  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.41 
 
 
184 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34260  conserved protein of DIM6/NTAB family  48.05 
 
 
174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  43.59 
 
 
168 aa  121  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.06 
 
 
178 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.03 
 
 
169 aa  111  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  39.76 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  46 
 
 
174 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  36.25 
 
 
169 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.66 
 
 
170 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  38.22 
 
 
179 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 
170 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  38.99 
 
 
226 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0470  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.61 
 
 
170 aa  104  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  45.22 
 
 
168 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
169 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  42.67 
 
 
170 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.97 
 
 
190 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
226 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1583  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.22 
 
 
166 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00544341 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
226 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  38.61 
 
 
169 aa  101  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  37.58 
 
 
306 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.95 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6217  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.41 
 
 
158 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1583  flavin reductase domain-containing protein  42.18 
 
 
166 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  36.08 
 
 
193 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.38 
 
 
168 aa  97.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  40.3 
 
 
311 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  34.19 
 
 
168 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.27 
 
 
330 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  35.58 
 
 
311 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  35.9 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.21 
 
 
190 aa  95.1  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
167 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  32.3 
 
 
188 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  39.07 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  32.95 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.25 
 
 
170 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  32.3 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.01 
 
 
180 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
175 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.22 
 
 
201 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.77 
 
 
174 aa  92  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  35.54 
 
 
408 aa  91.7  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  35.63 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.88 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  36.49 
 
 
177 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.06 
 
 
311 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.84 
 
 
311 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  37.5 
 
 
170 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  31.29 
 
 
187 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  33.17 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  34.19 
 
 
182 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  35.15 
 
 
191 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
169 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.26 
 
 
169 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  33.12 
 
 
161 aa  88.6  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  35.26 
 
 
169 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.77 
 
 
191 aa  88.6  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
175 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
162 aa  88.2  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  36.94 
 
 
175 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  33.75 
 
 
172 aa  88.2  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  37.82 
 
 
174 aa  87.8  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
322 aa  88.2  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  35.1 
 
 
183 aa  88.2  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.96 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  36.08 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  37.34 
 
 
346 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  36.6 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
171 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
171 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
171 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  36.54 
 
 
171 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
169 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.4 
 
 
192 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  35.9 
 
 
169 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.13 
 
 
169 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.4 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
171 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
171 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
169 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  36.54 
 
 
171 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.19 
 
 
311 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  30.25 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5310  flavoprotein oxidoreductase  33.74 
 
 
181 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00829883  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02120  conserved protein of DIM6/NTAB family  36 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
169 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
169 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  30.25 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  35.9 
 
 
169 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  37.09 
 
 
202 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  30.25 
 
 
204 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>