231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5743 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5743  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 73 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 740 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  38.89 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 795 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 740 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  34.33 
 
 		 1182 aa  51.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  32.39 
 
 		 824 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  37.5 
 
 		 803 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 709 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 813 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 802 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 744 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 801 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 835 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 817 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 754 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 806 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 831 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  31.75 
 
 		 565 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 732 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  30.65 
 
 		 743 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  39.66 
 
 		 811 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 		 811 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  32.86 
 
 		 758 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  37.1 
 
 		 562 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 724 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  28.36 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 814 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 926 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0334  heavy metal-binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000340547  normal  0.151356 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  32.35 
 
 		 971 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 713 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  34.48 
 
 		 797 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 734 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 830 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  31.67 
 
 		 778 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2465  heavy metal translocating P-type ATPase  30.43 
 
 		 876 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 938 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  35.29 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  32.84 
 
 		 562 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  36.67 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  30.16 
 
 		 564 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  35.29 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1568  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 758 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  29.23 
 
 		 750 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  35.29 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  35.29 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11673  probable copper-transporting ATPase  23.53 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  35.29 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 836 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 760 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  30.16 
 
 		 564 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  35.29 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  35.29 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  35.29 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  30.16 
 
 		 765 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2405  heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  33.33 
 
 		 792 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 815 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2045  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0135722  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  35.29 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 720 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 824 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 871 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  33.93 
 
 		 786 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 826 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2464  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 689 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 777 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  31.88 
 
 		 792 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 849 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 743 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  34.48 
 
 		 837 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 803 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  30.3 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 777 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4423  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 817 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 890 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  33.85 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  31.43 
 
 		 835 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 704 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0315  hypothetical protein  38.1 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  30 
 
 		 861 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 738 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 814 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  34.43 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 1182 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>