More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1027 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  54.56 
 
 		 704 aa  705    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  55.38 
 
 		 814 aa  715    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  55.92 
 
 		 758 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  49.87 
 
 		 712 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  55.83 
 
 		 756 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  62.36 
 
 		 712 aa  675    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 777 aa  1501    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  56.9 
 
 		 744 aa  745    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  57.24 
 
 		 716 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  57.54 
 
 		 726 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  56.97 
 
 		 734 aa  751    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  48.96 
 
 		 738 aa  667    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  56.1 
 
 		 955 aa  729    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  54.47 
 
 		 734 aa  697    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  50.79 
 
 		 904 aa  660    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  60.09 
 
 		 678 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  56.84 
 
 		 844 aa  744    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  59.37 
 
 		 759 aa  726    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  59.45 
 
 		 759 aa  729    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  55.05 
 
 		 757 aa  686    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  56.98 
 
 		 764 aa  751    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  50.26 
 
 		 720 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  47.97 
 
 		 793 aa  627  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  50.26 
 
 		 758 aa  625  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  51.39 
 
 		 740 aa  621  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  51.45 
 
 		 718 aa  621  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  51.45 
 
 		 740 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  52.8 
 
 		 731 aa  618  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  52.06 
 
 		 803 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  50.33 
 
 		 732 aa  617  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  49.34 
 
 		 711 aa  611  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  51.96 
 
 		 731 aa  599  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  48.75 
 
 		 713 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 		 709 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  42.58 
 
 		 773 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  56.07 
 
 		 722 aa  562  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3467  heavy metal translocating P-type ATPase  55.06 
 
 		 634 aa  554  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  45.83 
 
 		 768 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.56 
 
 		 803 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01515  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.96 
 
 		 689 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.18 
 
 		 768 aa  512  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.24 
 
 		 732 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.24 
 
 		 732 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.24 
 
 		 732 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.07 
 
 		 732 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.07 
 
 		 732 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  50.58 
 
 		 732 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  50.58 
 
 		 732 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.76 
 
 		 728 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  50.58 
 
 		 732 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.58 
 
 		 732 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.58 
 
 		 732 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.58 
 
 		 732 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  49.35 
 
 		 771 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.41 
 
 		 732 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.58 
 
 		 732 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.25 
 
 		 732 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.52 
 
 		 784 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.68 
 
 		 787 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  39.75 
 
 		 799 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 		 701 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  39.87 
 
 		 750 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  39.16 
 
 		 800 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  39.16 
 
 		 800 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  39.87 
 
 		 750 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 		 750 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  45.64 
 
 		 709 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  44.17 
 
 		 707 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  46.47 
 
 		 750 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  40.06 
 
 		 712 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  39.75 
 
 		 712 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  40.22 
 
 		 712 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 		 800 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  36.58 
 
 		 767 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  45.56 
 
 		 728 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  45.56 
 
 		 728 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  43.07 
 
 		 726 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  42.96 
 
 		 673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 		 984 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 		 984 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 800 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 800 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.84 
 
 		 782 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  47.34 
 
 		 812 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  42.06 
 
 		 794 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  45.34 
 
 		 801 aa  445  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46 
 
 		 782 aa  446  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  44.43 
 
 		 791 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.48 
 
 		 788 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  40.4 
 
 		 799 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  43.07 
 
 		 752 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  46.39 
 
 		 734 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  45.72 
 
 		 712 aa  439  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  45.22 
 
 		 799 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  37.89 
 
 		 713 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.15 
 
 		 709 aa  435  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  45.15 
 
 		 748 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  46.39 
 
 		 785 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  45.81 
 
 		 866 aa  432  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  41.42 
 
 		 737 aa  432  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>