82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5044 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5044  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 56 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  72.92 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  68.09 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  65.22 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  62.22 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  60 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  56.6 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  58.7 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  51.02 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  60.98 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  59.52 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  55.56 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  61.22 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  60 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  54.35 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  60.42 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  48.08 
 
 		 336 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  51.22 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  48.89 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  53.66 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  56.1 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  47.73 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.5 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  58.54 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.5 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 347 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  55.26 
 
 		 337 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  54.05 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 337 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  48.84 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  45.28 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  36.73 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 349 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  34.69 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  34.69 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  34.69 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  34.69 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  34.69 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  34.69 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  34.69 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 337 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  34.69 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  37.78 
 
 		 110 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 120 aa  40.8  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  51.28 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 115 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>