51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4946 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 431 aa  853    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  53.94 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  48.74 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  49.09 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  47.48 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  46.67 
 
 		 450 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  45.12 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2461  von Willebrand factor type A  45.45 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0207463  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  45.61 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  37.81 
 
 		 476 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  37.19 
 
 		 962 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4249  hypothetical protein  46.9 
 
 		 145 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.832481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  29.06 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.52 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  27.57 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.28 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.6 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  26 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.57 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  26 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.27 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.57 
 
 		 740 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  24.64 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 		 421 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.58 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.26 
 
 		 725 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.57 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.91 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  33.04 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.02 
 
 		 738 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  25.76 
 
 		 888 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  27.44 
 
 		 892 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  26.92 
 
 		 602 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.46 
 
 		 772 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  24.53 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.8 
 
 		 760 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  24.73 
 
 		 771 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  38.89 
 
 		 774 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.46 
 
 		 772 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  28.8 
 
 		 317 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.81 
 
 		 791 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.46 
 
 		 755 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>