More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4660 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  78.64 
 
 		 447 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 413 aa  835    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  49.04 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  51.82 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  48.67 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  46.23 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.43 
 
 		 407 aa  346  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  46 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  47.82 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  41.57 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  35.07 
 
 		 418 aa  264  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  34.35 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  32.06 
 
 		 432 aa  219  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  33.26 
 
 		 453 aa  216  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  30.22 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  31.4 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  34.67 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  34.69 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  33.18 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  31.49 
 
 		 446 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  31.28 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  31.22 
 
 		 446 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  36.59 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  34.41 
 
 		 450 aa  206  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  31.4 
 
 		 471 aa  206  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  29.98 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 		 442 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  33.89 
 
 		 478 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  35.47 
 
 		 459 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  35.27 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  33.18 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  36.48 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  29.35 
 
 		 452 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  36.88 
 
 		 458 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  32.47 
 
 		 484 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  34.41 
 
 		 458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  32.9 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  33.75 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  36.26 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  34.15 
 
 		 467 aa  196  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  32.83 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  33.71 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  31.49 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  31.72 
 
 		 474 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  35.17 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  36.03 
 
 		 433 aa  194  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  32.47 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  31.75 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  31.36 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  31.83 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  34.87 
 
 		 488 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  32.76 
 
 		 482 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  31.96 
 
 		 474 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  34.22 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  33.93 
 
 		 437 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  33.92 
 
 		 474 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  32.98 
 
 		 488 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  32.82 
 
 		 472 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  33.83 
 
 		 489 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  32.1 
 
 		 478 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  33.7 
 
 		 439 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  31.29 
 
 		 458 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  33.03 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  33.85 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  34 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  32.53 
 
 		 500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  33.11 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  33.91 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  32.12 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  36.69 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  29.78 
 
 		 462 aa  180  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  32.36 
 
 		 450 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  33.26 
 
 		 440 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  33.41 
 
 		 479 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  26.62 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  32.97 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  31.99 
 
 		 447 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  32.9 
 
 		 482 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  32.82 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  32.27 
 
 		 449 aa  176  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  29.31 
 
 		 451 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  31.05 
 
 		 482 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  31.12 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  28.45 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  32.59 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  30.82 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  31.48 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  32.37 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  31.4 
 
 		 470 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  29.12 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  29.58 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  31.18 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  29.8 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  32.7 
 
 		 487 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  33.12 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  88.51 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  29.01 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>