52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4472 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  260  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  96.64 
 
 		 355 aa  228  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  95.8 
 
 		 355 aa  226  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  92.44 
 
 		 355 aa  223  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  93.28 
 
 		 355 aa  219  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  89.92 
 
 		 355 aa  214  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  89.08 
 
 		 161 aa  212  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  61.86 
 
 		 357 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  60.42 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  81.94 
 
 		 303 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  56.36 
 
 		 214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  53.91 
 
 		 368 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  89.66 
 
 		 412 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  56.52 
 
 		 368 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  54.78 
 
 		 368 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  54.78 
 
 		 368 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  54.78 
 
 		 356 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  53.91 
 
 		 252 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  59.6 
 
 		 342 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  53.04 
 
 		 395 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  51.3 
 
 		 368 aa  103  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  80.95 
 
 		 299 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  50.42 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  94.12 
 
 		 51 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  50 
 
 		 370 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  52.43 
 
 		 214 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  52 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  97.78 
 
 		 54 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  54.88 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  53.66 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  45 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  86.84 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3411  hypothetical protein  63.16 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  83.33 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  35.51 
 
 		 341 aa  63.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  33.63 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  33.63 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 341 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  35.92 
 
 		 341 aa  60.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4076  hypothetical protein  90.91 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  37.3 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1465  hypothetical protein  77.78 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4365  hypothetical protein  77.78 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  34 
 
 		 350 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  31.62 
 
 		 355 aa  50.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  33.02 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  26.56 
 
 		 364 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2306  hypothetical protein  44.19 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2898  hypothetical protein  44.19 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  31.62 
 
 		 355 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2874  hypothetical protein  40.28 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110212  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00390  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase, putative  37.5 
 
 		 1030 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>